SignatureKernel#

class SignatureKernel(kernel=None, level=2, degree=1, theta=1, normalize=False, lowrank=False, rankbound=inf)[source]#

时间序列签名核,包括高阶和低秩变体。

实现 Kiraly 等人的签名核,参见 [1][2],包括其中描述的高阶和低秩近似变体。

参数:
kernelsktime 对对(表格)转换器,可调用,或 None

签名序列核中使用的内部(表格)核 如果可调用:函数 (2D np.ndarray x 2D np.ndarray) -> 2D np.ndarray 对对核函数,矩阵大小 (n, d) x (m, d) -> (n x m) 可选,默认 = None = 尺度参数为 1 的欧几里得(线性)核

levelint,可选,默认 = 2

一个大于等于 1 的整数,表示序列核的截断级别

degreeint,可选,默认 = 1

一个大于等于 1 的整数,表示序列核的近似阶数 仅在 lowrank = False 时可设置,否则忽略(始终 = 1)

thetafloat,可选,默认=1.0

一个正的尺度因子,用于各级别,第 i 级按 theta^i 进行缩放

normalizebool,可选,默认 = False

输出核矩阵是否归一化 如果为 True,和与累积和除以 prod(K.shape)

lowrankbool,可选,默认 = False

计算核时是否使用低秩近似

rankboundint,可选,默认 = infinity

级别矩阵秩的硬阈值 仅在 lowrank = True 时使用

属性:
is_fitted

fit 方法是否已被调用。

参考文献

[1]

F. Kiraly, H. Oberhauser. 2016. “Kernels for sequentially ordered data.”, arXiv: 1601.08169.

[2]

F. Kiraly, H. Oberhauser. 2019. “Kernels for sequentially ordered data.”, Journal of Machine Learning Research.

方法

__call__(X[, X2])

计算距离/核矩阵,调用简写。

check_is_fitted([method_name])

检查估计器是否已拟合。

clone()

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

clone_tags(estimator[, tag_names])

将另一个对象的标签克隆为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

使用第一个测试参数集构造类的实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例列表及其名称列表。

fit([X, X2])

用于接口兼容性的拟合方法(内部无逻辑)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

get_class_tags()

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

get_config()

获取自身的配置标志。

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的默认参数值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

get_tags()

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化内存容器加载对象。

reset()

将对象重置为干净的初始化后状态。

save([path, serialization_format])

将序列化自身保存到类字节对象或到 (.zip) 文件。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

transform(X[, X2])

计算距离/核矩阵。

transform_diag(X)

计算距离/核矩阵的对角线。

check_is_fitted(method_name=None)[source]#

检查估计器是否已拟合。

检查 _is_fitted 属性是否存在且为 True。在调用对象的 fit 方法时,is_fitted 属性应设置为 True

如果不是,则引发 NotFittedError

参数:
method_namestr,可选

调用此函数的方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[source]#

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

克隆是一个不同的对象,没有共享引用,处于初始化后状态。此函数等同于返回 sklearn.cloneself

等同于构造一个新的 type(self) 实例,使用 self 的参数,即 type(self)(**self.get_params(deep=False))

如果在 self 上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用 cloned_self.set_config(**self.get_config())

在值上也等同于调用 self.reset,区别在于 clone 返回一个新对象,而不是像 reset 那样修改 self

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 错误,则引发 RuntimeError。
clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#

将另一个对象的标签克隆为动态覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

clone_tags 从另一个对象 estimator 设置动态标签覆盖。

clone_tags 方法只能在对象的 __init__ 方法中调用,在构造期间,或通过 __init__ 直接在构造之后调用。

动态标签被设置为 estimator 中标签的值,名称由 tag_names 指定。

tag_names 的默认值将 estimator 中的所有标签写入 self

当前标签值可以通过 get_tagsget_tag 查看。

参数:
estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
tag_namesstr 或 str 列表,默认 = None

要克隆的标签名称。默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签。

返回:
self

self 的引用。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#

使用第一个测试参数集构造类的实例。

参数:
parameter_setstr,默认值="default"

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
instance具有默认参数的类实例
classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#

创建所有测试实例列表及其名称列表。

参数:
parameter_setstr,默认值="default"

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

names字符串列表,长度与 objs 相同

第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称。如果实例不止一个,命名约定为 {cls.__name__}-{i},否则为 {cls.__name__}

fit(X=None, X2=None)[source]#

用于接口兼容性的拟合方法(内部无逻辑)。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。

get_class_tag 方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它从对象中返回名称为 tag_name 的标签的值,按以下降序优先级考虑标签覆盖

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要检索包含潜在实例覆盖的标签值,请改用 get_tag 方法。

参数:
tag_namestr

标签值的名称。

tag_value_default任意类型

如果未找到标签,则使用的默认/回退值。

返回:
tag_value

selftag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[source]#

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_class_tags 方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 属性的任何键。

值是相应的标签值,覆盖按以下降序优先级排序

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

实例可以根据超参数覆盖这些标签。

要检索包含潜在实例覆盖的标签,请改用 get_tags 方法。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

对于包含动态标签的覆盖,请使用 get_tags

collected_tagsdict

标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集。不受通过 set_tagsclone_tags 设置的动态标签覆盖。

get_config()[source]#

获取自身的配置标志。

配置是 self 的键值对,通常用作控制行为的临时标志。

get_config 返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。

默认配置在类或其父类的类属性 _config 中设置,并被通过 set_config 设置的动态配置覆盖。

配置在 clonereset 调用下保留。

返回:
config_dictdict

配置名称 : 配置值 对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[source]#

获取拟合参数。

所需状态

要求状态为“已拟合”。

参数:
deepbool,默认为 True

是否返回组件的已拟合参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值字典,包括可拟合组件的已拟合参数(= BaseEstimator 类型参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值字典,但不包括组件的已拟合参数。

返回:
fitted_params带有字符串键的字典

已拟合参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有已拟合参数,通过 get_param_names 获取的值是此对象该键的已拟合参数值

  • 如果 deep=True,也包含组件参数的键/值对,组件的参数通过 [componentname]__[paramname] 索引 componentname 的所有参数都以 paramname 及其值的形式出现

  • 如果 deep=True,也包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

classmethod get_param_defaults()[source]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 的所有在 __init__ 中定义了默认值的参数。值是默认值,如 __init__ 中所定义。

classmethod get_param_names(sort=True)[source]#

获取对象的参数名称。

参数:
sortbool,默认为 True

是否按字母顺序 (True) 返回参数名称,或按它们在类 __init__ 中出现的顺序 (False) 返回。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,顺序与它们在类 __init__ 中出现的顺序相同。如果 sort=True,则按字母排序。

get_params(deep=True)[source]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
deepbool,默认为 True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值 dict,包括组件的参数(= BaseObject 类型参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值 dict,但不包括组件的参数。

返回:
params带有字符串键的字典

参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是此对象该键的参数值,值始终与构造时传递的值相同

  • 如果 deep=True,也包含组件参数的键/值对,组件的参数通过 [componentname]__[paramname] 索引 componentname 的所有参数都以 paramname 及其值的形式出现

  • 如果 deep=True,也包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_tag 方法从实例中检索名称为 tag_name 的单个标签的值,按以下降序优先级考虑标签覆盖

  1. 通过实例上的 set_tagsclone_tags 设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

参数:
tag_namestr

要检索的标签的名称

tag_value_default任意类型,可选;默认为 None

如果未找到标签,则使用的默认/回退值

raise_errorbool

未找到标签时是否引发 ValueError

返回:
tag_valueAny

selftag_name 标签的值。如果未找到,则在 raise_error 为 True 时引发错误,否则返回 tag_value_default

引发:
ValueError,如果 raise_errorTrue

如果 tag_name 不在 self.get_tags().keys() 中,则会引发 ValueError

get_tags()[source]#

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_tags 方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 属性的任何键,或通过 set_tagsclone_tags 设置的标签。

值是相应的标签值,覆盖按以下降序优先级排序

  1. 通过实例上的 set_tagsclone_tags 设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

返回:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集,然后是来自 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
parameter_setstr,默认值="default"

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊的参数,则将返回 "default" 集。目前距离/核变换器没有保留的值。

返回:
paramsdict 或 list of dict,默认为 {}

用于创建类测试实例的参数。每个字典都是用于构造一个“有趣”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一的)字典

is_composite()[source]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

对象是否有任何参数的值是 BaseObject 的后代实例。

property is_fitted[source]#

fit 方法是否已被调用。

检查对象的 _is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为 ``False,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。

返回:
bool

估计器是否已 fit

classmethod load_from_path(serial)[source]#

从文件位置加载对象。

参数:
serialZipFile(path).open(“object) 的结果
返回:
反序列化后的 self,结果位于 path,与 cls.save(path) 的输出相同
classmethod load_from_serial(serial)[source]#

从序列化内存容器加载对象。

参数:
serialcls.save(None) 输出的第一个元素
返回:
反序列化后的 self,结果为 serial,与 cls.save(None) 的输出相同
reset()[source]#

将对象重置为干净的初始化后状态。

导致将 self 设置为构造函数调用后立即达到的状态,具有相同的超参数。通过 set_config 设置的配置值也保留。

一个 reset 调用会删除所有对象属性,除了

  • 超参数 = __init__ 的参数写入 self,例如 self.paramname,其中 paramname__init__ 的参数

  • 包含双下划线,即字符串“__”的对象属性。例如,名为“__myattr”的属性会被保留。

  • 配置属性,配置会原封不动地保留。也就是说,reset 前后 get_config 的结果是相同的。

类方法和对象方法以及类属性也不受影响。

等同于 clone,不同之处在于 reset 改变 self 而不是返回一个新对象。

在调用 self.reset() 后,self 在值和状态上等于构造函数调用 type(self)(**self.get_params(deep=False)) 后获得的对象。

返回:
self

重置为干净的初始化后状态,但保留当前超参数值的类实例。

save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#

将序列化自身保存到类字节对象或到 (.zip) 文件。

行为:如果 path 为 None,则返回一个内存中的序列化 self;如果 path 是文件位置,则将 self 以 zip 文件形式存储在该位置

保存的文件是 zip 文件,包含以下内容:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self);_obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方法 (pickle)。

参数:
pathNone 或文件位置 (str 或 Path)

如果为 None,self 将保存到内存对象中;如果是文件位置,self 将保存到该文件位置。

  • 如果 path="estimator",则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件 estimator.zip

  • 如果 path="/home/stored/estimator",则会在

/home/stored/ 存储一个 zip 文件 estimator.zip

serialization_format: str,默认为 “pickle”

用于序列化的模块。可用选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回:
如果 path 为 None - 内存中的序列化 self
如果 path 是文件位置 - ZipFile 对象,引用该文件
set_config(**config_dict)[source]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值 对的字典。有效的配置、值及其含义如下所述

displaystr,“diagram”(默认)或“text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 框图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool,默认为 True

打印 self 时是仅列出与默认值不同的 self 参数 (True),还是列出所有参数名称和值 (False)。不进行嵌套,即仅影响 self 而不影响组件估计器。

warningsstr,“on”(默认)或“off”

是否发出警告,仅影响 sktime 的警告

  • “on” = 会发出 sktime 的警告

  • “off” = 不会发出 sktime 的警告

backend:parallelstr,可选,默认为“None”

广播/向量化时用于并行化的后端之一:

  • “None”:顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”:使用 dask,需要在环境中安装 dask

  • “ray”:使用 ray,需要在环境中安装 ray

backend:parallel:paramsdict,可选,默认为 {} (不传递参数)

作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效的键取决于 backend:parallel 的值

  • “None”:没有附加参数,backend_params 被忽略

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的 joblib 后端,这里可以传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobs,除了 backend,它由 backend 直接控制。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。这里可以传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobsbackend 在这种情况下必须作为 backend_params 的一个键传递。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”:可以传递 dask.compute 的任何有效键,例如 scheduler

  • “ray”:可以传递以下键

    • “ray_remote_args”:ray.init 的有效键字典

    • “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 可阻止 ray 在并行化后

      关闭。

    • “logger_name”:str,默认为“ray”;要使用的日志器名称。

    • “mute_warnings”:bool,默认为 False;如果为 True,则抑制警告

返回:
self对 self 的引用。

注意

更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[source]#

设置此对象的参数。

此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串 <component>__<parameter> 可用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果引用是明确的,也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>,例如,没有两个组件参数同名 <parameter>

参数:
**paramsdict

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。__ 后缀如果对于 get_params 键是唯一的,则可以作为完整字符串的别名。

返回:
self对 self 的引用(参数设置后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 self.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为源自 random_state 的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 从链式哈希中抽样得到,保证了种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy,应用于 self 中的 random_state 参数,以及仅当 deep=True 时应用于剩余组件对象。

注意:即使 self 没有 random_state 参数,或者没有任何组件具有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 对象,即使是没有 random_state 参数的对象。

参数:
random_stateint、RandomState 实例或 None,默认 None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传入 int 可在多次函数调用中获得可重现的输出。

deepbool,默认为 True

是否在 skbase 对象值参数(即组件估计器)中设置随机状态。

  • 如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。

  • 如果为 True,也将设置组件对象中的 random_state 参数。

self_policystr,{'copy', 'keep', 'new'} 之一,默认 'copy'
  • "copy" : self.random_state 设置为输入的 random_state

  • "keep" : self.random_state 保持不变

  • "new" : self.random_state 设置为一个新的随机状态,

源自输入的 random_state,通常与其不同

返回:
self指向 self 的引用
set_tags(**tag_dict)[source]#

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会更改。它们可用于元数据检查,或控制对象的行为。

set_tags 将动态标签覆盖设置为 tag_dict 中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要设置的标签值。

set_tags 方法应仅在对象构建期间的 __init__ 方法中调用,或在通过 __init__ 构建后立即调用。

当前标签值可以通过 get_tagsget_tag 查看。

参数:
**tag_dictdict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
Self

指向 self 的引用。

transform(X, X2=None)[source]#

计算距离/核矩阵。

行为:返回 X 和 X2(如果未传入,则等于 X)中样本之间的成对距离/核矩阵

X 和 X2 中的样本之间 (如果未传递,则等于 X)

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,python 类型如下

Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

符合 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,m 个实例

可选,默认:X = X2

要转换的数据,python 类型如下

Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

符合 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X 和 X2 无需具有相同的 mtype

返回:
distmat: shape 为 [n, m] 的 np.array

(i,j) 项包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核

transform_diag(X)[source]#

计算距离/核矩阵的对角线。

行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,python 类型如下

Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

符合 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

返回:
diag: shape 为 [n] 的 np.array

i 项包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核