DtwDistTslearn#
- class DtwDistTslearn(global_constraint=None, sakoe_chiba_radius=None, itakura_max_slope=None, n_jobs=None, verbose=0)[source]#
动态时间规整距离,来自 tslearn。
直接接口:
tslearn.metrics.cdist_dtw
。- 参数:
- global_constraint{“itakura”, “sakoe_chiba”} 或 None (默认: None)
全局约束,用于限制 DTW 的允许路径。
- sakoe_chiba_radiusint 或 None (默认: None)
用于 Sakoe-Chiba 带全局约束的半径。如果为 None 且
global_constraint
设置为"sakoe_chiba"
,则使用半径 1。如果同时设置了sakoe_chiba_radius
和itakura_max_slope
,则global_constraint
用于推断使用两者中的哪个约束。在这种情况下,如果global_constraint
对应于没有全局约束,则会引发RuntimeWarning
并未使用全局约束。- itakura_max_slopefloat 或 None (默认: None)
Itakura 平行四边形约束的最大斜率。如果为 None 且
global_constraint
设置为"itakura"
,则使用最大斜率 2。如果同时设置了sakoe_chiba_radius
和itakura_max_slope
,则global_constraint
用于推断使用两者中的哪个约束。在这种情况下,如果global_constraint
对应于没有全局约束,则会引发RuntimeWarning
并未使用全局约束。- n_jobsint 或 None,可选 (默认=None)
并行运行的作业数。
None
表示 1,除非在joblib.parallel_backend
上下文中。-1
表示使用所有处理器。- verboseint,可选 (默认=0)
冗余级别:如果非零,则打印进度消息。高于 50,输出发送到 stdout。消息频率随冗余级别增加而增加。如果大于 10,则报告所有迭代。
- 属性:
is_fitted
是否已调用
fit
。
参考
[1]H. Sakoe, S. Chiba,“语音识别的动态规划算法优化”,IEEE Transactions on Acoustics, Speech and Signal Processing,第 26(1) 卷,第 43–49 页,1978 年。
方法
__call__
(X[, X2])计算距离/核矩阵,调用简写。
check_is_fitted
([method_name])检查估算器是否已拟合。
clone
()获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例列表及其名称列表。
fit
([X, X2])用于接口兼容性的拟合方法(内部无逻辑)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类获取类标签值,并从父类继承标签级别。
从类获取类标签,并从父类继承标签级别。
获取自身的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取拟合参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例获取标签值,并带有标签级别继承和覆盖。
get_tags
()从实例获取标签,并带有标签级别继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估算器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
重置
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化后的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级别的标签覆盖设置为给定值。
transform
(X[, X2])计算距离/核矩阵。
计算距离/核矩阵的对角线。
- 类方法 get_test_params(parameter_set='default')[source]#
返回估算器的测试参数设置。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,将返回
"default"
集。距离/核变换器目前没有保留值。
- 返回:
- paramsdict 或 list of dict, 默认值 = {}
用于创建类测试实例的参数。每个 dict 都是用于构造“有趣”测试实例的参数,例如
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典。
- check_is_fitted(method_name=None)[source]#
检查估算器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。在调用对象的fit
方法时,应将is_fitted
属性设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr, 可选
调用此函数的方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[source]#
获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
克隆是一个没有共享引用的不同对象,处于初始化后状态。此函数等效于返回
self
的sklearn.clone
。等效于构造
type(self)
的新实例,使用self
的参数,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,则克隆对象也将具有与原始对象相同的配置,等效于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。在值上也等效于调用
self.reset
,但clone
返回一个新对象,而reset
会修改self
。- 引发:
- 如果克隆对象不符合规范,由于
__init__
错误,则会引发 RuntimeError。
- 如果克隆对象不符合规范,由于
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,对象构造后不会更改。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法只能在对象的__init__
方法中、构造期间或通过__init__
构造后直接调用。动态标签设置为
estimator
中标签的值,名称由tag_names
指定。tag_names
的默认设置将estimator
中的所有标签写入self
。当前标签值可以通过
get_tags
或get_tag
查看。- 参数:
- estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- tag_namesstr 或 list of str, 默认值 = None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回:
- self
对
self
的引用。
- 类方法 create_test_instance(parameter_set='default')[source]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- instance具有默认参数的类实例
- 类方法 create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#
创建所有测试实例列表及其名称列表。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是
cls(**cls.get_test_params()[i])
- namesstr 列表,与 objs 长度相同
第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称。如果实例多于一个,命名约定为
{cls.__name__}-{i}
,否则为{cls.__name__}
。
- 类方法 get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#
从类获取类标签值,并从父类继承标签级别。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。get_class_tag
方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它从对象返回名称为
tag_name
的标签值,考虑标签覆盖,优先级降序排列如下:在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要检索可能具有实例覆盖的标签值,请使用
get_tag
方法。- 参数:
- tag_namestr
标签值的名称。
- tag_value_default任意类型
如果未找到标签,则使用默认值/回退值。
- 返回:
- tag_value
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,则返回tag_value_default
。
- 类方法 get_class_tags()[source]#
从类获取类标签,并从父类继承标签级别。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,对象构造后不会更改。get_class_tags
方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的
_tags
的任何属性的键。值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下:
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索可能具有实例覆盖的标签,请使用
get_tags
方法。不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要包含来自动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名称:标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不会被set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[source]#
获取自身的配置标志。
配置是
self
的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。get_config
返回动态配置,它们会覆盖默认配置。默认配置在类或其父类的类属性
_config
中设置,并被通过set_config
设置的动态配置覆盖。配置在
clone
或reset
调用后保留。- 返回:
- config_dictdict
配置名称:配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后从 _onfig_dynamic 对象属性收集任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[source]#
获取拟合参数。
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 参数:
- deepbool, 默认值=True
是否返回组件的已拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名称:值字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 类型参数)的已拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名称:值字典,但不包括组件的已拟合参数。
- 返回:
- fitted_params具有 str 类型键的 dict
已拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括
总是:此对象的所有已拟合参数,通过
get_param_names
获得,值是该键对应的此对象的已拟合参数值如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对,组件的参数索引为[componentname]__[paramname]
,componentname
的所有参数都以paramname
及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等。
- 类方法 get_param_defaults()[source]#
获取对象的参数默认值。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
中在__init__
中定义了默认值的所有参数。值是默认值,如__init__
中所定义。
- 类方法 get_param_names(sort=True)[source]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- sortbool, 默认值=True
是按字母顺序(True)还是按它们在类
__init__
中出现的顺序(False)返回参数名称。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,则按它们在类__init__
中出现的相同顺序排列。如果sort=True
,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[source]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- deepbool, 默认值=True
是否返回组件的参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名称:值dict
,包括组件(=BaseObject
类型参数)的参数。如果为
False
,将返回此对象的参数名称:值dict
,但不包括组件的参数。
- 返回:
- params具有 str 类型键的 dict
参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括
总是:此对象的所有参数,通过
get_param_names
获得,值是该键对应的此对象的参数值,值始终与构造时传递的值相同。如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对,组件的参数索引为[componentname]__[paramname]
,componentname
的所有参数都以paramname
及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等。
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#
从实例获取标签值,并带有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,对象构造后不会更改。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签的值,考虑标签覆盖,优先级降序排列如下:通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- tag_namestr
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型, 可选; 默认值=None
如果未找到标签,则使用默认值/回退值。
- raise_errorbool
未找到标签时是否引发
ValueError
- 返回:
- tag_valueAny
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,且raise_error
为 True,则引发错误,否则返回tag_value_default
。
- 引发:
- ValueError,如果
raise_error
为True
。 当
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中时,会引发ValueError
。
- ValueError,如果
- get_tags()[source]#
从实例获取标签,并带有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,对象构造后不会更改。get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
的任何属性的键,或通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下:
通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名称:标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后从_tags_dynamic
对象属性收集任何覆盖和新标签。
- is_composite()[source]#
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
复合对象是一个包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
对象是否具有任何参数,其值是
BaseObject
的派生实例。
- 属性 is_fitted[source]#
是否已调用
fit
。检查对象的
_is_fitted
属性,该属性应在对象构造期间初始化为False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回:
- bool
估计器是否已 拟合。
- 类方法 load_from_path(serial)[source]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- serialZipFile(path).open(“object”) 的结果
- 返回:
- 反序列化自身,生成位于
path
的输出,即cls.save(path)
的结果。
- 反序列化自身,生成位于
- 类方法 load_from_serial(serial)[source]#
从序列化内存容器加载对象。
- 参数:
- serial
cls.save(None)
输出的第一个元素
- serial
- 返回:
- 反序列化自身,生成输出
serial
,即cls.save(None)
的结果。
- 反序列化自身,生成输出
- reset()[source]#
将对象重置为干净的初始化后状态。
结果是将
self
设置为构造函数调用后立即拥有的状态,并具有相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也会保留。reset
调用会删除除以下各项之外的任何对象属性:超参数 = 写入
self
的__init__
的参数,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的参数。包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性会被保留。
配置属性,配置不变地保留。也就是说,
reset
前后get_config
的结果是相等的。
类和对象方法以及类属性也不受影响。
等效于
clone
,但reset
会修改self
,而不是返回一个新对象。在调用
self.reset()
后,self
在值和状态上与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。- 返回:
- self
类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#
将序列化后的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
行为:如果
path
为 None,则返回一个内存中的序列化自身;如果path
是文件位置,则将自身在该位置存储为 zip 文件。保存的文件是包含以下内容的 zip 文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self);_obj - 序列化的自身。此类使用默认序列化 (pickle)。
- 参数:
- pathNone 或 文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,则将自身保存到内存对象;如果是文件位置,则将自身保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则会在
/home/stored/
中存储一个 zip 文件estimator.zip
。- serialization_format: str, 默认值 = “pickle”
用于序列化的模块。可用选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中的序列化自身 - 如果
path
是文件位置 - ZipFile,引用该文件
- 如果
- set_config(**config_dict)[source]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名称:配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:
- displaystr, “diagram” (默认), 或 “text”
jupyter 内核如何显示自身实例
“diagram” = html 框图表示
“text” = 字符串输出
- print_changed_onlybool, 默认值=True
打印自身时是否只列出自参数中与默认值不同的参数 (False),或者列出所有参数名称和值 (False)。不嵌套,即只影响自身,不影响组件估计器。
- warningsstr, “on” (默认), 或 “off”
是否发出警告,仅影响来自 sktime 的警告。
“on” = 将发出来自 sktime 的警告
“off” = 将不发出来自 sktime 的警告
- backend:parallelstr, 可选, 默认值=”None”
广播/矢量化时用于并行处理的后端,以下之一:
“None”: 顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel
“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”: 使用
dask
,需要在环境中安装dask
包“ray”: 使用
ray
,需要在环境中安装ray
包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认值={} (未传递参数)
作为配置传递给并行处理后端的附加参数。有效的键取决于
backend:parallel
的值。“None”: 没有附加参数,
backend_params
被忽略。“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认的
joblib
后端,此处可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,但backend
除外,它由backend
直接控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。此处可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,在这种情况下,必须将backend
作为backend_params
的键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“dask”: 可以传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”: 可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”: bool, 默认值=True; False 可防止
ray
在并行化后 关闭。
- “shutdown_ray”: bool, 默认值=True; False 可防止
“logger_name”: str, 默认值=”ray”; 要使用的日志记录器名称。
“mute_warnings”: bool, 默认值=False; 如果为 True,则抑制警告。
- 返回:
- self对自身的引用。
注意
更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[source]#
设置此对象的参数。
此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>
可用于复合对象(即包含其他对象的对象),以访问组件<component>
中的<parameter>
。如果引用明确,例如没有两个组件参数名称相同,也可以使用不带<component>__
的字符串<parameter>
。- 参数:
- paramsdict
BaseObject 参数,键必须是
<component>__<parameter>
字符串。__
后缀可以作为完整字符串的别名,如果它在 get_params 键中是唯一的。
- 返回:
- self对自身的引用(设置参数后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#
为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
self.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。适用于
self
中的random_state
参数(取决于self_policy
),并且仅当deep=True
时才适用于剩余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者任何组件都没有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是没有random_state
参数的对象。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认值=None
控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递 int 可在多次函数调用中获得可复现的输出。
- deepbool, 默认值=True
是否在 skbase 对象值参数(即组件估计器)中设置随机状态。
如果为 False,则只设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,也将设置组件对象中的
random_state
参数。
- self_policystr, 以下之一 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值=”copy”
“copy” :
self.random_state
设置为输入random_state
“keep” :
self.random_state
保持不变“new” :
self.random_state
设置为新的随机状态,
从输入
random_state
派生,通常与其不同。
- 返回:
- self对自身的引用
- set_tags(**tag_dict)[source]#
将实例级别的标签覆盖设置为给定值。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,对象构造后不会更改。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,dict 值是要将标签设置为的值。set_tags
方法只能在对象的__init__
方法中、构造期间或通过__init__
构造后直接调用。当前标签值可以通过
get_tags
或get_tag
查看。- 参数:
- tag_dictdict
标签名称:标签值对的字典。
- 返回:
- Self
对自身的引用。
- transform(X, X2=None)[source]#
计算距离/核矩阵。
- 行为:返回成对距离/核矩阵
X 和 X2 中样本之间的距离/核矩阵(如果未传递 X2,则等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
- 要变换的数据,Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 受 sktime mtype 格式规范限制,详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,共 m 个实例
可选,默认值: X = X2
- 要变换的数据,Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 受 sktime mtype 格式规范限制,详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
X 和 X2 不必具有相同的 mtype
- 返回:
- distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array
(i,j) 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[source]#
计算距离/核矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线。
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
- 要变换的数据,Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 受 sktime mtype 格式规范限制,详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 返回:
- diag: 形状为 [n] 的 np.array
第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核