CombinedDistance#

class CombinedDistance(pw_trafos, operation=None)[source]#

通过算术运算(例如,加法、乘法)组合的距离。

CombinedDistance 通过对多个距离矩阵执行算术运算(np.ufunc),从多个其他成对变换创建成对变换。

对于一个变换器列表 trafo1, trafo2, …, trafoN 和 ufunc operation,这个组合器行为如下:transform(X, X2) - 计算 dist1 = trafo1.transform(X, X2),

dist2 = trafo2.transform(X, X2), …, distN = trafoN.transform(X, X2)`,所有这些的形状都是 (len(X), len(X2),然后逐元素应用 operation,得到一个形状为 (len(X), len(X2) 的单一矩阵 dist。示例:如果 operation = np.sum,则 distdist1, dist2, …, distN 的逐元素和。

参数:
pw_trafossktime 成对面板距离列表,或

sktime 成对面板距离的元组列表 (str, transformer),使用 operation 组合成单个距离

operationNone, str, function 或 numpy ufunc,可选,默认 = None = mean

如果是 str,必须是 “mean”, “+” (加), “*” (乘), “max”, “min” 之一;如果是 func,必须是签名 (1D iterable) -> float,对距离矩阵执行的操作

属性:
is_fitted

fit 是否已被调用。

示例

>>> from sktime.dists_kernels.algebra import CombinedDistance
>>> from sktime.dists_kernels.dtw import DtwDist
>>> from sktime.datasets import load_unit_test
>>>
>>> X, _ = load_unit_test()
>>> X = X[0:3]
>>> sum_dist = CombinedDistance([DtwDist(), DtwDist(weighted=True)], "+")
>>> dist_mat = sum_dist.transform(X)

使用 dunders 也可以更简洁地完成同样的操作

>>> sum_dist = DtwDist() + DtwDist(weighted=True)
>>> dist_mat = sum_dist(X)

方法

__call__(X[, X2])

计算距离/核函数矩阵,调用简写形式。

check_is_fitted([method_name])

检查估计器是否已拟合。

clone()

获取一个具有相同超参数和配置的对象克隆。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

使用第一个测试参数集构造类的实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。

fit([X, X2])

用于接口兼容性的拟合方法(内部没有逻辑)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

get_class_tags()

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

get_config()

获取自身的配置标志。

get_fitted_params([deep])

获取已拟合的参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取估计器的参数。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从实例获取标签值,包括标签级别继承和覆盖。

get_tags()

从实例获取标签,包括标签级别继承和覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否是复合对象。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器加载对象。

reset()

将对象重置到干净的初始化后状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**kwargs)

设置估计器的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将实例级标签覆盖设置为给定值。

transform(X[, X2])

计算距离/核矩阵。

transform_diag(X)

计算距离/核矩阵的对角线。

check_is_fitted(method_name=None)[source]#

检查估计器是否已拟合。

检查 _is_fitted 属性是否存在且为 True。在调用对象的 fit 方法时,应将 is_fitted 属性设置为 True

如果不是,则引发 NotFittedError

参数:
method_namestr,可选

调用此函数的方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。

引发
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[source]#

获取一个具有相同超参数和配置的对象克隆。

克隆是一个没有共享引用的不同对象,处于初始化后状态。此函数等同于返回 sklearn.cloneself

等同于构造一个 type(self) 的新实例,使用 self 的参数,即 type(self)(**self.get_params(deep=False))

如果在 self 上设置了配置,克隆也将拥有与原始对象相同的配置,等同于调用 cloned_self.set_config(**self.get_config())

在值上也等同于调用 self.reset,区别在于 clone 返回一个新对象,而不是像 reset 那样改变 self

引发
如果由于 __init__ 错误导致克隆不符合要求,则会引发 RuntimeError。
clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

clone_tags 从另一个对象 estimator 设置动态标签覆盖。

clone_tags 方法应仅在对象的 __init__ 方法中调用,即在构造期间或通过 __init__ 构造后立即调用。

动态标签设置为 estimator 中标签的值,名称在 tag_names 中指定。

tag_names 的默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签到 self

当前标签值可通过 get_tagsget_tag 检查。

参数:
estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
tag_namesstr 或 str 列表,默认为 None

要克隆的标签名称。默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签。

返回
self

self 的引用。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#

使用第一个测试参数集构造类的实例。

参数:
parameter_setstr,默认为“default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回 “default” 集。

返回
instance具有默认参数的类实例
classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#

创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。

参数:
parameter_setstr,默认为“default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回 “default” 集。

返回
objscls 实例列表

第 i 个实例为 cls(**cls.get_test_params()[i])

namesstr 列表,长度与 objs 相同

第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称。如果实例多于一个,命名约定为 {cls.__name__}-{i},否则为 {cls.__name__}

fit(X=None, X2=None)[source]#

用于接口兼容性的拟合方法(内部没有逻辑)。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。

get_class_tag 方法是类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它从对象中返回名称为 tag_name 的标签值,考虑了标签覆盖,优先级降序如下:

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要检索具有潜在实例覆盖的标签值,请改用 get_tag 方法。

参数:
tag_namestr

标签值的名称。

tag_value_default任意类型

如果未找到标签,则使用的默认/备用值。

返回
tag_value

selftag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[source]#

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_class_tags 方法是类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它返回一个字典,其中键是类或其任何父类中设置的 _tags 的任何属性的键。

值是相应的标签值,覆盖优先级降序如下:

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

实例可以根据超参数覆盖这些标签。

要检索具有潜在实例覆盖的标签,请改用 get_tags 方法。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

若要包含动态标签的覆盖,请使用 get_tags

collected_tagsdict

标签名 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集。不会被 set_tagsclone_tags 设置的动态标签覆盖。

get_config()[source]#

获取自身的配置标志。

配置是 self 的键值对,通常用作控制行为的临时标志。

get_config 返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。

默认配置设置在类或其父类的类属性 _config 中,并被通过 set_config 设置的动态配置覆盖。

配置在 clonereset 调用下得以保留。

返回
config_dictdict

配置名 : 配置值 对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后包括来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[source]#

获取已拟合的参数。

所需状态

要求状态为“fitted”。

参数:
deepbool,默认为 True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值 字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 值参数)的拟合参数。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值 字典,但不包括组件的拟合参数。

返回
fitted_params键为 str 类型的字典

拟合参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对,包括

  • 总是:此对象的所有拟合参数,通过 get_param_names 获取,值是此对象该键的拟合参数值

  • 如果 deep=True,也包含组件参数的键值对;组件参数的索引格式为 [componentname]__[paramname]componentname 的所有参数都以 paramname 形式出现并带其值

  • 如果 deep=True,也包含任意层级的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

classmethod get_param_defaults()[source]#

获取对象的默认参数。

返回
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中所有在 __init__ 中定义了默认值的参数。值是在 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[source]#

获取对象的参数名称。

参数:
sortbool,默认为 True

是否按字母顺序返回参数名称 (True),或者按其在类 __init__ 中出现的顺序返回 (False)。

返回
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按其在类 __init__ 中出现的相同顺序。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[source]#

获取估计器的参数。

参数:
deep布尔值,可选

如果为 True,将返回此估计器及其包含的作为估计器的子对象的参数。

返回
params字符串到任意类型的映射

参数名称映射到其值。

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#

从实例获取标签值,包括标签级别继承和覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tag 方法从实例中检索名称为 tag_name 的单个标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下:

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构建时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

参数:
tag_namestr

要检索的标签名称

tag_value_default任意类型,可选;默认为 None

如果未找到标签,则使用的默认/备用值

raise_errorbool

未找到标签时是否引发 ValueError

返回
tag_valueAny

selftag_name 标签的值。如果未找到,且 raise_error 为 True,则引发错误,否则返回 tag_value_default

引发
ValueError,如果 raise_errorTrue

如果 tag_name 不在 self.get_tags().keys() 中,则引发 ValueError

get_tags()[source]#

从实例获取标签,包括标签级别继承和覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tags 方法返回一个标签字典,其中键是类或其任何父类中设置的 _tags 的任何属性的键,或者通过 set_tagsclone_tags 设置的标签。

值是相应的标签值,覆盖优先级降序如下:

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构建时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

返回
collected_tagsdict

标签名 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集,然后包括来自 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
parameter_setstr,默认为“default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回 "default" 集。

返回
paramsdict 或 list of dict,默认为 {}

用于创建类的测试实例的参数。每个 dict 都是用于构造一个“有趣”测试实例的参数,例如 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典。

is_composite()[source]#

检查对象是否是复合对象。

复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回
composite: bool,self 是否包含一个作为 BaseObject 的参数
property is_fitted[source]#

fit 是否已被调用。

检查对象的 _is_fitted 属性,该属性在对象构造期间应初始化为 False,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。

返回
bool

估计器是否已 fit

classmethod load_from_path(serial)[source]#

从文件位置加载对象。

参数:
serialZipFile(path).open(“object) 的结果
返回
反序列化的 self,结果输出到 path,是 cls.save(path) 的输出。
classmethod load_from_serial(serial)[source]#

从序列化的内存容器加载对象。

参数:
serialcls.save(None) 输出的第一个元素
返回
反序列化的 self,结果输出 serial,是 cls.save(None) 的输出。
reset()[source]#

将对象重置到干净的初始化后状态。

self 设置为构造函数调用后立即所处的状态,具有相同的超参数。通过 set_config 设置的配置值也会保留。

reset 调用删除所有对象属性,除了

  • 超参数 = 写入 self__init__ 参数,例如 self.paramname,其中 paramname__init__ 的一个参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性被保留。

  • 配置属性,配置不变。也就是说,get_configreset 前后的结果相等。

类和对象方法以及类属性也不受影响。

等同于 clone,区别在于 reset 修改 self 而不是返回一个新对象。

在调用 self.reset() 后,self 在值和状态上与构造函数调用``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。

返回
self

类实例被重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#

将序列化的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。

行为:如果 path 为 None,返回一个内存中的序列化 self;如果 path 是文件位置,将 self 以 zip 文件形式存储在该位置

保存的文件是 zip 文件,包含以下内容:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self);_obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方式 (pickle)。

参数:
pathNone 或文件位置 (str 或 Path)

如果为 None,则 self 保存到内存对象;如果是文件位置,则 self 保存到该文件位置。如果

  • path=”estimator”,则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件 estimator.zip

  • path=”/home/stored/estimator”,则会在

/home/stored/ 中存储一个 zip 文件 estimator.zip

serialization_format: str,默认为 “pickle”

用于序列化的模块。可用选项有 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回
如果 path 为 None - 内存中的序列化 self
如果 path 是文件位置 - 指向文件的 ZipFile
set_config(**config_dict)[source]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名 : 配置值 对的字典。有效的配置、值及其含义如下:

displaystr,“diagram”(默认)或“text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = HTML 框图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool,默认为 True

打印 self 时是只列出与默认值不同的 self 参数 (False),还是列出所有参数名称和值 (False)。不嵌套,即仅影响 self,而不影响组件估计器。

warningsstr,“on”(默认)或“off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 将不引发来自 sktime 的警告

backend:parallelstr,可选,默认为“None”

广播/向量化时用于并行化的后端,可选值包括

  • “None”:顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”:使用 dask,需要在环境中安装 dask

  • “ray”:使用 ray,需要在环境中安装 ray

backend:parallel:paramsdict,可选,默认为 {} (未传递参数)

作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于 backend:parallel 的值

  • “None”:没有附加参数,忽略 backend_params

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的 joblib 后端。任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,但 backend 除外,它直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs。在此情况下,backend 必须作为 backend_params 的一个键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “dask”:可以传递 dask.compute 的任何有效键,例如 scheduler

  • “ray”:可以传递以下键

    • “ray_remote_args”:ray.init 的有效键字典

    • “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 会阻止 ray

      并行化后关闭。

    • “logger_name”:str,默认为“ray”;要使用的日志记录器名称。

    • “mute_warnings”:bool,默认为 False;如果为 True,则抑制警告

返回
self对 self 的引用。

注意

改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**kwargs)[source]#

设置估计器的参数。

有效的参数键可以通过 get_params() 列出。

返回
self返回 self 的一个实例。
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 self.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为从 random_state 派生的整数。这些整数通过链式哈希从 sample_dependent_seed 中采样,保证了种子随机生成器的伪随机独立性。

应用到 self 中的 random_state 参数,取决于 self_policy,并且仅当 deep=True 时应用于剩余的组件对象。

注意:即使 self 没有 random_state 参数,或者没有组件有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 会重置任何 scikit-base 对象,即使那些没有 random_state 参数的对象也会被重置。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None,默认为 None

控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递 int 以在多次函数调用中获得可重现的输出。

deepbool,默认为 True

是否在 skbase 对象值参数(即组件估计器)中设置随机状态。

  • 如果为 False,将仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。

  • 如果为 True,也将设置组件对象中的 random_state 参数。

self_policystr,可选值为 {“copy”, “keep”, “new”} 之一,默认为“copy”
  • “copy”:将 self.random_state 设置为输入的 random_state

  • “keep”:保留 self.random_state 不变

  • “new”:将 self.random_state 设置为一个新的随机状态,

派生自输入的 random_state,通常与它不同

返回
self对 self 的引用
set_tags(**tag_dict)[source]#

将实例级标签覆盖设置为给定值。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。

set_tags 将动态标签覆盖设置为 tag_dict 中指定的值,其中键是标签名,字典值是要设置的标签值。

set_tags 方法应仅在对象的 __init__ 方法中调用,即在构造期间或通过 __init__ 构造后立即调用。

当前标签值可通过 get_tagsget_tag 检查。

参数:
**tag_dictdict

标签名: 标签值 对的字典。

返回
Self

对 self 的引用。

transform(X, X2=None)[source]#

计算距离/核矩阵。

行为:返回 pairwise 距离/核矩阵

在 X 和 X2 中的样本之间(如果未传递 X2,则等于 X)

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
要转换的数据,Python 类型如下

Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame

遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,共 m 个实例

可选,默认:X = X2

要转换的数据,Python 类型如下

Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame

遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X 和 X2 不需要具有相同的 mtype

返回
distmat: np.array,形状为 [n, m]

(i,j) 元素包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核

transform_diag(X)[source]#

计算距离/核矩阵的对角线。

行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
要转换的数据,Python 类型如下

Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame

遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

返回
diag: np.array,形状为 [n]

第 i 个元素包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核