CombinedDistance#
- class CombinedDistance(pw_trafos, operation=None)[source]#
通过算术运算(例如,加法、乘法)组合的距离。
CombinedDistance
通过对多个距离矩阵执行算术运算(np.ufunc),从多个其他成对变换创建成对变换。对于一个变换器列表
trafo1
,trafo2
, …,trafoN
和 ufuncoperation
,这个组合器行为如下:transform(X, X2)
- 计算dist1 = trafo1.transform(X, X2)
,dist2 = trafo2.transform(X, X2)
, …, distN = trafoN.transform(X, X2)`,所有这些的形状都是(len(X), len(X2)
,然后逐元素应用operation
,得到一个形状为(len(X), len(X2)
的单一矩阵dist
。示例:如果operation = np.sum
,则dist
是dist1
,dist2
, …,distN
的逐元素和。- 参数:
- pw_trafossktime 成对面板距离列表,或
sktime 成对面板距离的元组列表 (str, transformer),使用 operation 组合成单个距离
- operationNone, str, function 或 numpy ufunc,可选,默认 = None = mean
如果是 str,必须是 “mean”, “+” (加), “*” (乘), “max”, “min” 之一;如果是 func,必须是签名 (1D iterable) -> float,对距离矩阵执行的操作
- 属性:
is_fitted
fit
是否已被调用。
示例
>>> from sktime.dists_kernels.algebra import CombinedDistance >>> from sktime.dists_kernels.dtw import DtwDist >>> from sktime.datasets import load_unit_test >>> >>> X, _ = load_unit_test() >>> X = X[0:3] >>> sum_dist = CombinedDistance([DtwDist(), DtwDist(weighted=True)], "+") >>> dist_mat = sum_dist.transform(X)
使用 dunders 也可以更简洁地完成同样的操作
>>> sum_dist = DtwDist() + DtwDist(weighted=True) >>> dist_mat = sum_dist(X)
方法
__call__
(X[, X2])计算距离/核函数矩阵,调用简写形式。
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
clone
()获取一个具有相同超参数和配置的对象克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。
fit
([X, X2])用于接口兼容性的拟合方法(内部没有逻辑)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。
从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。
获取自身的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取已拟合的参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取估计器的参数。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例获取标签值,包括标签级别继承和覆盖。
get_tags
()从实例获取标签,包括标签级别继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否是复合对象。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化的内存容器加载对象。
reset
()将对象重置到干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**kwargs)设置估计器的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级标签覆盖设置为给定值。
transform
(X[, X2])计算距离/核矩阵。
计算距离/核矩阵的对角线。
- check_is_fitted(method_name=None)[source]#
检查估计器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。在调用对象的fit
方法时,应将is_fitted
属性设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr,可选
调用此函数的方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[source]#
获取一个具有相同超参数和配置的对象克隆。
克隆是一个没有共享引用的不同对象,处于初始化后状态。此函数等同于返回
sklearn.clone
的self
。等同于构造一个
type(self)
的新实例,使用self
的参数,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,克隆也将拥有与原始对象相同的配置,等同于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。在值上也等同于调用
self.reset
,区别在于clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样改变self
。- 引发:
- 如果由于
__init__
错误导致克隆不符合要求,则会引发 RuntimeError。
- 如果由于
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中调用,即在构造期间或通过__init__
构造后立即调用。动态标签设置为
estimator
中标签的值,名称在tag_names
中指定。tag_names
的默认值 (None
) 克隆estimator
中的所有标签到self
。当前标签值可通过
get_tags
或get_tag
检查。- 参数:
- estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- tag_namesstr 或 str 列表,默认为 None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回:
- self
对
self
的引用。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- parameter_setstr,默认为“default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回 “default” 集。
- 返回:
- instance具有默认参数的类实例
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#
创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。
- 参数:
- parameter_setstr,默认为“default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例为
cls(**cls.get_test_params()[i])
- namesstr 列表,长度与 objs 相同
第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称。如果实例多于一个,命名约定为
{cls.__name__}-{i}
,否则为{cls.__name__}
。
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#
从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。get_class_tag
方法是类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它从对象中返回名称为
tag_name
的标签值,考虑了标签覆盖,优先级降序如下:在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要检索具有潜在实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。- 参数:
- tag_namestr
标签值的名称。
- tag_value_default任意类型
如果未找到标签,则使用的默认/备用值。
- 返回:
- tag_value
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,则返回tag_value_default
。
- classmethod get_class_tags()[source]#
从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_class_tags
方法是类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它返回一个字典,其中键是类或其任何父类中设置的
_tags
的任何属性的键。值是相应的标签值,覆盖优先级降序如下:
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索具有潜在实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。若要包含动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不会被set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[source]#
获取自身的配置标志。
配置是
self
的键值对,通常用作控制行为的临时标志。get_config
返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。默认配置设置在类或其父类的类属性
_config
中,并被通过set_config
设置的动态配置覆盖。配置在
clone
或reset
调用下得以保留。- 返回:
- config_dictdict
配置名 : 配置值 对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后包括来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[source]#
获取已拟合的参数。
- 所需状态
要求状态为“fitted”。
- 参数:
- deepbool,默认为 True
是否返回组件的拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值 字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 值参数)的拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值 字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回:
- fitted_params键为 str 类型的字典
拟合参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对,包括
总是:此对象的所有拟合参数,通过
get_param_names
获取,值是此对象该键的拟合参数值如果
deep=True
,也包含组件参数的键值对;组件参数的索引格式为[componentname]__[paramname]
,componentname
的所有参数都以paramname
形式出现并带其值如果
deep=True
,也包含任意层级的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- classmethod get_param_defaults()[source]#
获取对象的默认参数。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
中所有在__init__
中定义了默认值的参数。值是在__init__
中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[source]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- sortbool,默认为 True
是否按字母顺序返回参数名称 (True),或者按其在类
__init__
中出现的顺序返回 (False)。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,则按其在类__init__
中出现的相同顺序。如果sort=True
,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[source]#
获取估计器的参数。
- 参数:
- deep布尔值,可选
如果为 True,将返回此估计器及其包含的作为估计器的子对象的参数。
- 返回:
- params字符串到任意类型的映射
参数名称映射到其值。
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#
从实例获取标签值,包括标签级别继承和覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下:通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构建时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- tag_namestr
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型,可选;默认为 None
如果未找到标签,则使用的默认/备用值
- raise_errorbool
未找到标签时是否引发
ValueError
- 返回:
- tag_valueAny
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,且raise_error
为 True,则引发错误,否则返回tag_value_default
。
- 引发:
- ValueError,如果
raise_error
为True
。 如果
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中,则引发ValueError
。
- ValueError,如果
- get_tags()[source]#
从实例获取标签,包括标签级别继承和覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tags
方法返回一个标签字典,其中键是类或其任何父类中设置的_tags
的任何属性的键,或者通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是相应的标签值,覆盖优先级降序如下:
通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构建时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后包括来自_tags_dynamic
对象属性的任何覆盖和新标签。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- parameter_setstr,默认为“default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值未定义特殊参数,则返回
"default"
集。
- 返回:
- paramsdict 或 list of dict,默认为 {}
用于创建类的测试实例的参数。每个 dict 都是用于构造一个“有趣”测试实例的参数,例如
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典。
- is_composite()[source]#
检查对象是否是复合对象。
复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool,self 是否包含一个作为 BaseObject 的参数
- property is_fitted[source]#
fit
是否已被调用。检查对象的
_is_fitted
属性,该属性在对象构造期间应初始化为False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回:
- bool
估计器是否已 fit。
- classmethod load_from_path(serial)[source]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- serialZipFile(path).open(“object) 的结果
- 返回:
- 反序列化的 self,结果输出到
path
,是cls.save(path)
的输出。
- 反序列化的 self,结果输出到
- classmethod load_from_serial(serial)[source]#
从序列化的内存容器加载对象。
- 参数:
- serial
cls.save(None)
输出的第一个元素
- serial
- 返回:
- 反序列化的 self,结果输出
serial
,是cls.save(None)
的输出。
- 反序列化的 self,结果输出
- reset()[source]#
将对象重置到干净的初始化后状态。
将
self
设置为构造函数调用后立即所处的状态,具有相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也会保留。reset
调用删除所有对象属性,除了超参数 = 写入
self
的__init__
参数,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的一个参数包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性被保留。
配置属性,配置不变。也就是说,
get_config
在reset
前后的结果相等。
类和对象方法以及类属性也不受影响。
等同于
clone
,区别在于reset
修改self
而不是返回一个新对象。在调用
self.reset()
后,self
在值和状态上与构造函数调用``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。- 返回:
- self
类实例被重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#
将序列化的自身保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
行为:如果
path
为 None,返回一个内存中的序列化 self;如果path
是文件位置,将 self 以 zip 文件形式存储在该位置保存的文件是 zip 文件,包含以下内容:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self);_obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方式 (pickle)。
- 参数:
- pathNone 或文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,则 self 保存到内存对象;如果是文件位置,则 self 保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则会在
/home/stored/
中存储一个 zip 文件estimator.zip
。- serialization_format: str,默认为 “pickle”
用于序列化的模块。可用选项有 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中的序列化 self - 如果
path
是文件位置 - 指向文件的 ZipFile
- 如果
- set_config(**config_dict)[source]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名 : 配置值 对的字典。有效的配置、值及其含义如下:
- displaystr,“diagram”(默认)或“text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = HTML 框图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_onlybool,默认为 True
打印 self 时是只列出与默认值不同的 self 参数 (False),还是列出所有参数名称和值 (False)。不嵌套,即仅影响 self,而不影响组件估计器。
- warningsstr,“on”(默认)或“off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 将不引发来自 sktime 的警告
- backend:parallelstr,可选,默认为“None”
广播/向量化时用于并行化的后端,可选值包括
“None”:顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”:使用
dask
,需要在环境中安装dask
包“ray”:使用
ray
,需要在环境中安装ray
包
- backend:parallel:paramsdict,可选,默认为 {} (未传递参数)
作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值“None”:没有附加参数,忽略
backend_params
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的
joblib
后端。任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
,但backend
除外,它直接由backend
控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
。在此情况下,backend
必须作为backend_params
的一个键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“dask”:可以传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”:可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 会阻止
ray
在 并行化后关闭。
- “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 会阻止
“logger_name”:str,默认为“ray”;要使用的日志记录器名称。
“mute_warnings”:bool,默认为 False;如果为 True,则抑制警告
- 返回:
- self对 self 的引用。
注意
改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#
为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
self.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
派生的整数。这些整数通过链式哈希从sample_dependent_seed
中采样,保证了种子随机生成器的伪随机独立性。应用到
self
中的random_state
参数,取决于self_policy
,并且仅当deep=True
时应用于剩余的组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者没有组件有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
会重置任何scikit-base
对象,即使那些没有random_state
参数的对象也会被重置。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None,默认为 None
控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递 int 以在多次函数调用中获得可重现的输出。
- deepbool,默认为 True
是否在 skbase 对象值参数(即组件估计器)中设置随机状态。
如果为 False,将仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,也将设置组件对象中的
random_state
参数。
- self_policystr,可选值为 {“copy”, “keep”, “new”} 之一,默认为“copy”
“copy”:将
self.random_state
设置为输入的random_state
“keep”:保留
self.random_state
不变“new”:将
self.random_state
设置为一个新的随机状态,
派生自输入的
random_state
,通常与它不同
- 返回:
- self对 self 的引用
- set_tags(**tag_dict)[source]#
将实例级标签覆盖设置为给定值。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名,字典值是要设置的标签值。set_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中调用,即在构造期间或通过__init__
构造后立即调用。当前标签值可通过
get_tags
或get_tag
检查。- 参数:
- **tag_dictdict
标签名: 标签值 对的字典。
- 返回:
- Self
对 self 的引用。
- transform(X, X2=None)[source]#
计算距离/核矩阵。
- 行为:返回 pairwise 距离/核矩阵
在 X 和 X2 中的样本之间(如果未传递 X2,则等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,共 m 个实例
可选,默认:X = X2
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
X 和 X2 不需要具有相同的 mtype
- 返回:
- distmat: np.array,形状为 [n, m]
(i,j) 元素包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[source]#
计算距离/核矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,共 n 个实例
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series:pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D);Panel:具有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame,pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 返回:
- diag: np.array,形状为 [n]
第 i 个元素包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核