CtwDistTslearn#
- class CtwDistTslearn(max_iter=100, n_components=None, global_constraint=None, sakoe_chiba_radius=None, itakura_max_slope=None, n_jobs=None, verbose=0)[源代码]#
规范时间扭曲距离,来自 tslearn。
直接接口到
tslearn.metrics.cdist_ctw
。- 参数:
- max_iterint (默认值: 100)
CTW 算法的迭代次数。
- n_componentsint (默认值: None)
用于典型相关分析(Canonical Correlation Analysis)的组件数量。如果为 None,则使用输入的最小特征数量。
- global_constraint{“itakura”, “sakoe_chiba”} 或 None (默认值: None)
限制 DTW 可行路径的全局约束。
- sakoe_chiba_radiusint 或 None (默认值: None)
用于 Sakoe-Chiba 带全局约束的半径。如果为 None 且
global_constraint
设置为"sakoe_chiba"
,则半径为 1。如果同时设置了sakoe_chiba_radius
和itakura_max_slope
,则使用global_constraint
来推断使用两者中的哪个约束。在这种情况下,如果global_constraint
对应于没有全局约束,则会引发RuntimeWarning
并且不使用全局约束。- itakura_max_slopefloat 或 None (默认值: None)
Itakura 平行四边形约束的最大斜率。如果为 None 且
global_constraint
设置为"itakura"
,则使用最大斜率为 2。如果同时设置了sakoe_chiba_radius
和itakura_max_slope
,则使用global_constraint
来推断使用两者中的哪个约束。在这种情况下,如果global_constraint
对应于没有全局约束,则会引发RuntimeWarning
并且不使用全局约束。- verboseint, 可选 (默认值=0)
详细级别:如果非零,则打印进度消息。大于 50 时,输出发送到 stdout。消息频率随详细级别增加。如果大于 10,则报告所有迭代。
- 属性:
is_fitted
fit
是否已被调用。
参考文献
[1]F. Zhou and F. Torre, “Canonical time warping for alignment of human behavior”. NIPS 2009。
方法
__call__
(X[, X2])计算距离/核矩阵,调用简写。
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
clone
()获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])将其他对象的标签克隆为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。
fit
([X, X2])用于接口兼容性的拟合方法(内部无逻辑)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,具有从父类继承的标签级别。
从类中获取类标签,具有从父类继承的标签级别。
获取自身的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取拟合参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
get_tags
()从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
reset
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的 self 保存为 bytes-like 对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])设置 self 的 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级标签覆盖设置为给定值。
transform
(X[, X2])计算距离/核矩阵。
计算距离/核矩阵的对角线。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果一个值没有定义特殊的参数,则返回
"default"
集。距离/核变换器目前没有保留值。
- 返回:
- paramsdict 或 dict 列表, 默认值 = {}
用于创建类的测试实例的参数。每个 dict 都是用于构造一个“有趣”测试实例的参数,即
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典
- check_is_fitted(method_name=None)[源代码]#
检查估计器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。is_fitted
属性应在调用对象的fit
方法时设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr, 可选
调用此函数的方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[源代码]#
获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
克隆是一个不同的对象,没有共享引用,处于初始化后状态。此函数等效于返回
sklearn.clone
的self
。等效于构造一个
type(self)
的新实例,使用self
的参数,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果
self
上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等效于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。值上也等效于调用
self.reset
,除了clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样改变self
。- 引发:
- 如果克隆不符合要求,由于错误的
__init__
,则引发 RuntimeError。
- 如果克隆不符合要求,由于错误的
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#
将其他对象的标签克隆为动态覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会改变。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中、构建期间或在__init__
后直接调用。动态标签设置为
estimator
中标签的值,名称在tag_names
中指定。tag_names
的默认值会将estimator
中的所有标签写入self
。可以通过
get_tags
或get_tag
检查当前标签值。- 参数:
- estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- tag_namesstr 或 str 列表, 默认值 = None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回:
- self
引用
self
。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果一个值没有定义特殊的参数,则返回 “default” 集。
- 返回:
- instance具有默认参数的类的实例
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#
创建所有测试实例的列表以及它们的名称列表。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果一个值没有定义特殊的参数,则返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是
cls(**cls.get_test_params()[i])
- namesstr 列表, 长度与 objs 相同
第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称。命名约定是
{cls.__name__}-{i}
,如果多于一个实例;否则为{cls.__name__}
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#
从类中获取类标签值,具有从父类继承的标签级别。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。get_class_tag
方法是一个类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。它返回名称为
tag_name
的标签在对象中的值,并考虑标签覆盖,优先级从高到低如下:在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑在实例上通过
set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。要检索可能包含实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。- 参数:
- tag_namestr
标签名称。
- tag_value_default任意类型
如果未找到标签,则为默认/备用值。
- 返回:
- tag_value
self
中名称为tag_name
的标签的值。如果未找到,则返回tag_value_default
。
- classmethod get_class_tags()[源代码]#
从类中获取类标签,具有从父类继承的标签级别。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会改变。get_class_tags
方法是一个类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的
_tags
属性的任何键。值是相应的标签值,覆盖顺序从高到低如下:
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索可能包含实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。不考虑在实例上通过
set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。要包含动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名称:标签值对字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不被通过set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[源代码]#
获取自身的配置标志。
Configs 是
self
的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。get_config
返回动态 configs,它会覆盖默认 configs。默认 configs 在类或其父类的类属性
_config
中设置,并被通过set_config
设置的动态 configs 覆盖。Configs 在
clone
或reset
调用下保留。- 返回:
- config_dictdict
config 名称:config 值对字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[源代码]#
获取拟合参数。
- 所需状态
要求状态为“已拟合”。
- 参数:
- deepbool, 默认值=True
是否返回组件的拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名:参数值字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 值参数)的拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名:参数值字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回:
- fitted_paramskey 为 str 的 dict
拟合参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
始终:此对象的所有拟合参数,通过
get_param_names
值是此对象该键的拟合参数值如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为[componentname]__[paramname]
componentname
的所有参数都以paramname
及其值的形式出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- classmethod get_param_defaults()[源代码]#
获取对象的参数默认值。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
在__init__
中定义了默认值的所有参数。值是在__init__
中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- sortbool, 默认值=True
是否按字母顺序排序返回参数名称(True),或按它们在类
__init__
中出现的顺序返回(False)。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,则按它们在类__init__
中出现的顺序排列。如果sort=True
,则按字母顺序排序。
- get_params(deep=True)[源代码]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- deepbool, 默认值=True
是否返回组件的参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名:参数值dict
,包括组件(=BaseObject
值参数)的参数。如果为
False
,将返回此对象的参数名:参数值dict
,但不包括组件的参数。
- 返回:
- paramskey 为 str 的 dict
参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
始终:此对象的所有参数,通过
get_param_names
值是此对象该键的参数值 值始终与构造时传递的值相同如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为[componentname]__[paramname]
componentname
的所有参数都以paramname
及其值的形式出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#
从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会改变。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签的值,并考虑标签覆盖,优先级从高到低如下:通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- tag_namestr
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型, 可选; 默认值=None
如果未找到标签,则为默认/备用值
- raise_errorbool
如果未找到标签,是否引发
ValueError
- 返回:
- tag_valueAny
self
中名称为tag_name
的标签的值。如果未找到,如果raise_error
为 True,则引发错误,否则返回tag_value_default
。
- 引发:
- ValueError, 如果
raise_error
为True
。 如果
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中,则引发ValueError
。
- ValueError, 如果
- get_tags()[源代码]#
从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会改变。get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
属性的任何键,或通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是相应的标签值,覆盖顺序从高到低如下:
通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名称:标签值对字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后是来自_tags_dynamic
对象属性的任何覆盖和新标签。
- is_composite()[源代码]#
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
复合对象是指作为参数包含其他对象的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
对象是否有任何参数,其值为
BaseObject
派生实例。
- property is_fitted[源代码]#
fit
是否已被调用。检查对象的
_is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为 ``False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回:
- bool
估计器是否已 fit。
- classmethod load_from_path(serial)[源代码]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- serialZipFile(path).open(“object) 的结果
- 返回:
- 反序列化的 self,产生
path
位置的输出,即cls.save(path)
的输出
- 反序列化的 self,产生
- classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#
从序列化内存容器加载对象。
- 参数:
- serial
cls.save(None)
输出的第一个元素
- serial
- 返回:
- 反序列化的 self,产生
serial
输出,即cls.save(None)
的输出
- 反序列化的 self,产生
- reset()[源代码]#
将对象重置为干净的初始化后状态。
将
self
设置为构造函数调用后直接处于的状态,具有相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也保留。reset
调用会删除所有对象属性,除了超参数 =
__init__
的参数写入self
,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的参数包含双下划线(即字符串“__”)的对象属性。例如,名为“__myattr”的属性被保留。
配置属性,配置不变地保留。
get_config
在reset
前后的结果相同。
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
等效于
clone
,除了reset
会改变self
而不是返回一个新对象。在调用
self.reset()
后,self
的值和状态与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。- 返回:
- self
类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#
将序列化的 self 保存为 bytes-like 对象或 (.zip) 文件。
行为:如果
path
为 None,则返回内存中的序列化 self;如果path
是文件位置,则将 self 保存为 zip 文件到该位置。保存的文件是包含以下内容的 zip 文件:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认序列化(pickle)。
- 参数:
- pathNone 或文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,self 保存到内存对象中 如果是文件位置,self 保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则将在当前工作目录创建 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则 zip 文件
estimator.zip
将
存储在
/home/stored/
中。- serialization_format: str, 默认值 = “pickle”
用于序列化的模块。可选值有 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中的序列化 self - 如果
path
是文件位置 - 引用该文件的 ZipFile
- 如果
- set_config(**config_dict)[源代码]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
config 名称:config 值对字典。有效 config、值及其含义如下所示:
- displaystr, “diagram” (默认), 或 “text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = html 盒子图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_onlybool, 默认值=True
打印 self 时是否只列出自默认值不同的参数(False),或列出所有参数名称和值(False)。不嵌套,即只影响 self 而不影响组件估计器。
- warningsstr, “on” (默认), 或 “off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 不会引发来自 sktime 的警告
- backend:parallelstr, 可选, 默认值=”None”
广播/向量化时用于并行化的后端,以下之一:
“None”: 顺序执行循环,简单列表推导式
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel
“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”: 使用
dask
,需要在环境中安装dask
包“ray”: 使用
ray
,需要在环境中安装ray
包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认值={} (不传递参数)
作为 config 传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值“None”: 没有附加参数,
backend_params
被忽略“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认
joblib
后端 任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
,除了backend
,它由backend
直接控制。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
,在这种情况下,backend
必须作为backend_params
的一个键传递。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“dask”: 可以传递任何有效的
dask.compute
键,例如scheduler
“ray”: 可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”: bool, 默认值=True; False 可防止
ray
在并行化后关闭。 “logger_name”: str, 默认值=”ray”; 要使用的日志器名称。
- “shutdown_ray”: bool, 默认值=True; False 可防止
“mute_warnings”: bool, 默认值=False; 如果为 True,则抑制警告
self对 self 的引用。
- 返回:
- 注意事项
更改对象状态,将 config_dict 中的 config 复制到 self._config_dynamic。
-
该方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>
可用于复合对象(即包含其他对象的对象),以访问组件<component>
中的<parameter>
。字符串<parameter>
(不带<component>__
)也可以使用,如果此引用是明确的,例如组件的两个参数没有名称<parameter>
。 设置此对象的参数。
**paramsdict
-
通过
self.get_params
查找名称为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
通过sample_dependent_seed
链式哈希派生出的整数。这些整数保证了种子随机生成器的伪随机独立性。 设置 self 的 random_state 伪随机种子参数。
取决于
self_policy
应用于self
中的random_state
参数,且当且仅当deep=True
时应用于剩余的组件对象。适用于
self
中的random_state
参数(取决于self_policy
)以及仅当deep=True
时适用于其余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或没有任何组件对象具有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是那些没有random_state
参数的对象。- 参数:
- random_stateint、RandomState 实例或 None,默认为 None
用于控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递整数以在多次函数调用中获得可重现的输出。
- deepbool, 默认值=True
是否在 skbase 对象值参数(即组件估计器)中设置随机状态。
如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则也会设置组件对象中的
random_state
参数。
- self_policystr,{"copy", "keep", "new"} 中的一个,默认为 "copy"
“copy”:
self.random_state
被设置为输入的random_state
“keep”:
self.random_state
保持不变“new”:
self.random_state
被设置为一个新的随机状态,
源自输入的
random_state
,通常与输入的不同
- 返回:
- self对 self 的引用
- set_tags(**tag_dict)[source]#
将实例级标签覆盖设置为给定值。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构建后不会改变的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要设置的标签值。set_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中,即在构建期间或通过__init__
构建后直接调用。可以通过
get_tags
或get_tag
检查当前标签值。- 参数:
- **tag_dictdict
标签名:标签值 对的字典。
- 返回:
- Self
对 self 的引用。
- transform(X, X2=None)[source]#
计算距离/核矩阵。
- 行为:返回 X 和 X2 中样本之间的成对距离/核矩阵
(如果未传递,则 X2 等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,其 Python 类型如下
Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 m 个实例
可选,默认为:X = X2
- 要转换的数据,其 Python 类型如下
Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
X 和 X2 不需要具有相同的 mtype
- 返回:
- distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array
(i,j) 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[source]#
计算距离/核矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,其 Python 类型如下
Series: pd.Series、pd.DataFrame 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame、pd.DataFrame 列表、
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,详情请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 返回:
- diag: 形状为 [n] 的 np.array
第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核