AlignerLuckyDtw#
- class AlignerLuckyDtw(window=None)[source]#
基于幸运动态时间规整距离的对齐路径。
此对齐器返回幸运时间规整距离 [1]_ 生成的对齐路径。对多元数据使用欧氏距离。
基于 Krisztian A Buza 研究组的代码。
- 参数:
- window: int, 可选 (默认值=None)
对齐序列索引之间的最大距离,也称为规整窗口。如果为 None,则默认为 max(len(ts1), len(ts2)),即无规整窗口。
- 属性:
is_fitted
是否已调用
fit
。
参考文献
- ..[1] Stephan Spiegel, Brijnesh-Johannes Jain, and Sahin Albayrak.
基于幸运时间规整距离的快速时间序列分类。Proceedings of the 29th Annual ACM Symposium on Applied Computing. 2014.
方法
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
clone
()获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例列表及其名称列表。
fit
(X[, Z])给定要对齐的序列,拟合对齐。
返回传递给 fit 的序列的对齐版本。
返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (iloc 索引)。
返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (loc 索引)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。
从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。
获取 self 的配置标志。
返回对齐的整体距离。
返回对齐的距离矩阵。
get_fitted_params
([deep])获取拟合参数。
获取对象的默认参数。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
get_tags
()从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
reset
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的 self 保存到字节类似对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级别标签覆盖设置为给定值。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- **parameter_set**str, 默认值=”default”
返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回
"default"
集。目前没有为对齐器保留的值。
- 返回:
- **params**dict 或 dict 列表, 默认值 = {}
用于创建类的测试实例的参数。每个 dict 都是构造一个“有趣”测试实例的参数,即
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典。
- check_is_fitted(method_name=None)[source]#
检查估计器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。is_fitted
属性应在调用对象的fit
方法时设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- **method_name**str, 可选
调用此方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[source]#
获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
克隆是一个没有共享引用的不同对象,处于初始化后状态。此函数等同于返回
self
的sklearn.clone
。等同于使用
self
的参数构造type(self)
的新实例,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。在值上也等同于调用
self.reset
,但例外是clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样改变self
。- 引发:
- 如果由于错误的
__init__
导致克隆不符合规范,则引发 RuntimeError。
- 如果由于错误的
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法只能在对象的__init__
方法中调用,在构造期间,或在通过__init__
构造后直接调用。动态标签设置为
estimator
中标签的值,名称在tag_names
中指定。tag_names
的默认值将estimator
中的所有标签写入self
。当前的标签值可以通过
get_tags
或get_tag
进行检查。- 参数:
- **estimator**:class:BaseObject 或派生类的实例
- **tag_names**str 或 str 列表, 默认值 = None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回:
- self
self
的引用。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- **parameter_set**str, 默认值=”default”
返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- **instance**具有默认参数的类的实例
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#
创建所有测试实例列表及其名称列表。
- 参数:
- **parameter_set**str, 默认值=”default”
返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- **objs**cls 实例列表
第 i 个实例是
cls(**cls.get_test_params()[i])
- **names**str 列表, 长度与 objs 相同
第 i 个元素是测试中 obj 第 i 个实例的名称。如果实例多于一个,命名约定为
{cls.__name__}-{i}
,否则为{cls.__name__}
。
- fit(X, Z=None)[source]#
给定要对齐的序列,拟合对齐。
- 状态变化
将状态更改为“已拟合”。
- 写入 self
将 self._is_fitted 标志设置为 True。将 X 和 Z 分别存储到 self._X 和 self._Z。设置以“_”结尾的拟合模型属性。
- 参数:
- **X**长度为 n 的 pd.DataFrame (Series) 列表
要对齐的时间序列集合
- **Z**具有 n 行的 pd.DataFrame, 可选
元数据,Z 的第 i 行对应于 X 的第 i 个元素
- get_aligned()[source]#
返回传递给 fit 的序列的对齐版本。
- 行为: 返回传递给 fit 的 X 中未对齐序列的对齐版本
模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 访问 self
以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted
- 返回:
- X_aligned_list: 序列格式的 pd.DataFrame 列表
长度为 n,索引对应于传递给 fit 的 X 的索引 第 i 个元素是重新索引的,X[i] 的对齐版本
- get_alignment()[source]#
返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (iloc 索引)。
- 行为: 返回传递给 fit 的 X 中序列的对齐
模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 访问 self
以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted
- 返回:
- 对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) (其中 i 为整数)
列包含 X[i] 的 iloc 索引映射到对齐坐标
- get_alignment_loc()[source]#
返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (loc 索引)。
- 行为: 返回传递给 fit 的 X 中序列的对齐
模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 访问 self
以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted
- 返回:
- 对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) (其中 i 为整数)
列包含 X[i] 的 loc 索引映射到对齐坐标
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#
从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典,用于存储有关对象的元数据。get_class_tag
方法是类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。它从对象中返回名称为
tag_name
的标签值,考虑了标签覆盖,优先级降序排列如下在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要检索具有潜在实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。- 参数:
- **tag_name**str
标签值的名称。
- **tag_value_default**任意类型
如果找不到标签,则为默认/回退值。
- 返回:
- tag_value
self
中tag_name
标签的值。如果找不到,则返回tag_value_default
。
- classmethod get_class_tags()[source]#
从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_class_tags
方法是类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。它返回一个字典,键是类或其任何父类中设置的
_tags
任何属性的键。值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索具有潜在实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要包含来自动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不会被set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[source]#
获取 self 的配置标志。
Configs 是
self
的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。get_config
返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。默认配置在类或其父类的
_config
类属性中设置,并通过set_config
设置的动态配置覆盖。Configs 在
clone
或reset
调用下保留。- 返回:
- **config_dict**dict
配置名称 : 配置值 对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- get_distance()[source]#
返回对齐的整体距离。
- 行为: 返回与对齐对应的整体距离
并非所有对齐器都会返回或实现此功能(可选)
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 访问 self
以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted
- 返回:
- distance: float - 传递给 fit 的 X 的所有元素之间的整体距离
- get_distance_matrix()[source]#
返回对齐的距离矩阵。
- 行为: 返回对齐距离的成对距离矩阵
并非所有对齐器都会返回或实现此功能(可选)
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 访问 self
以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted
- 返回:
- distmat: 一个 (n x n) np.array (浮点数),其中 n 是传递给 fit 的 X 的长度
[i,j] 项是传递给 fit 的 X[i] 和 X[j] 之间的对齐距离
- get_fitted_params(deep=True)[source]#
获取拟合参数。
- 所需状态
需要状态为“已拟合”。
- 参数:
- **deep**bool, 默认值=True
是否返回组件的拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值 字典,包括可拟合组件 (= BaseEstimator 类型参数) 的拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值 字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回:
- **fitted_params**str 键的 dict
拟合参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对
总是: 此对象的所有拟合参数,如通过
get_param_names
获取,值是此对象该键的拟合参数值如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对。组件参数以[componentname]__[paramname]
形式索引,componentname
的所有参数以paramname
形式出现,带有其值如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- classmethod get_param_defaults()[source]#
获取对象的默认参数。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
中在__init__
中定义了默认值的所有参数。值是在__init__
中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[source]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- **sort**bool, 默认值=True
是否按字母顺序 (True) 或按它们在类
__init__
中出现的顺序 (False) 返回参数名称。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,按它们在类__init__
中出现的相同顺序排列。如果sort=True
,按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[source]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- **deep**bool, 默认值=True
是否返回组件的参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名称 : 值 的dict
,包括组件 (=BaseObject
类型参数) 的参数。如果为
False
,将返回此对象的参数名称 : 值 的dict
,但不包括组件的参数。
- 返回:
- **params**str 键的 dict
参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对
总是: 此对象的所有参数,如通过
get_param_names
获取,值是此对象该键的参数值。值始终与构造时传递的值相同如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对。组件参数以[componentname]__[paramname]
形式索引,componentname
的所有参数以paramname
形式出现,带有其值如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#
从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签的值,考虑了标签覆盖,优先级降序排列如下通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- **tag_name**str
要检索的标签名称
- **tag_value_default**任意类型, 可选; 默认值=None
如果找不到标签,则为默认/回退值
- **raise_error**bool
找不到标签时是否引发
ValueError
- 返回:
- **tag_value**Any
self
中tag_name
标签的值。如果找不到,并且raise_error
为 True,则引发错误,否则返回tag_value_default
。
- 引发:
- ValueError,如果
raise_error
为True
。 如果
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中,则引发ValueError
。
- ValueError,如果
- get_tags()[source]#
从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
的任何属性的键,或者通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下
通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回:
- **collected_tags**dict
标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后是来自_tags_dynamic
对象属性的任何覆盖和新标签。
- is_composite()[source]#
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
对象是否有任何参数的值是
BaseObject
的后代实例。
- property is_fitted[source]#
是否已调用
fit
。检查对象的
_is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为
``False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回:
- bool
估计器是否已 fit。
- classmethod load_from_path(serial)[source]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- **serial**ZipFile(path).open(“object”) 的结果
- 返回:
- 反序列化的 self,产生
cls.save(path)
在path
处的输出
- 反序列化的 self,产生
- classmethod load_from_serial(serial)[source]#
从序列化内存容器加载对象。
- 参数:
- **serial**
cls.save(None)
输出的第 1 个元素
- **serial**
- 返回:
- 反序列化的 self,产生
cls.save(None)
的输出serial
- 反序列化的 self,产生
- reset()[source]#
将对象重置为干净的初始化后状态。
结果是将
self
设置回构造函数调用后的状态,并保持相同的超参数。set_config
设置的配置值也会保留。reset
调用会删除任何对象属性,除了超参数 =
__init__
的参数,写入self
,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的一个参数包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性将被保留。
配置属性,配置保持不变。也就是说,
reset
前后get_config
的结果是相等的。
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
等同于
clone
,但例外是reset
改变self
而不是返回一个新对象。在调用
self.reset()
后,self
在值和状态上与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。- 返回:
- self
类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#
将序列化的 self 保存到字节类似对象或 (.zip) 文件。
行为: 如果
path
为 None,则返回内存中序列化的 self;如果path
是文件位置,则将 self 以 zip 文件形式存储在该位置保存的文件是 zip 文件,包含以下内容: _metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认序列化(pickle)。
- 参数:
- **path**None 或文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,self 保存到内存对象;如果是文件位置,self 保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则会在
/home/stored/
存储一个 zip 文件estimator.zip
。
存储在
/home/stored/
中。- serialization_format: str, 默认值 = “pickle”
用于序列化的模块。可用选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中序列化的 self - 如果
path
是文件位置 - 指向文件的 ZipFile
- 如果
- set_config(**config_dict)[source]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- **config_dict**dict
配置名称 : 配置值 对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示
- **display**str, “diagram”(默认)或“text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = html 框图表示
“text” = 字符串打印输出
- **print_changed_only**bool, 默认值=True
打印 self 时,是只列出与默认值不同的 self 参数 (False),还是列出所有参数名称和值 (False)。不进行嵌套,即仅影响 self,不影响组件估计器。
- **warnings**str, “on”(默认)或“off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 将不引发来自 sktime 的警告
- **backend:parallel**str, 可选, 默认值=”None”
广播/向量化时用于并行化的后端,可选值之一为
“None”: 顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel
“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”: 使用
dask
,需要在环境中安装dask
包“ray”: 使用
ray
,需要在环境中安装ray
包
- **backend:parallel:params**dict, 可选, 默认值={}(未传递参数)
作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值“None”: 没有附加参数,
backend_params
被忽略“loky”, “multiprocessing” and “threading”:默认的
joblib
后端,joblib.Parallel
的任何有效键都可以在此处传递,例如n_jobs
,除了backend
,它由backend
直接控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。joblib.Parallel
的任何有效键都可以在此处传递,例如n_jobs
。在这种情况下,backend
必须作为backend_params
的键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“dask”:可以传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”:可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”:bool,默认值=True;False 可防止
ray
在并行化后关闭。
- “shutdown_ray”:bool,默认值=True;False 可防止
“logger_name”:str,默认值=”ray”;要使用的记录器名称。
“mute_warnings”:bool,默认值=False;如果为 True,则禁止警告
- 返回:
- self对自身的引用。
注意
改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[来源]#
设置此对象的参数。
此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>
可用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件<component>
中的<parameter>
。如果引用明确无歧义,例如没有两个组件参数的名称相同,则也可以使用字符串<parameter>
,不带<component>__
。- 参数:
- **params字典
BaseObject 参数,键必须是
<component>__<parameter>
字符串。如果__
后缀在 get_params 键中是唯一的,则可以作为完整字符串的别名。
- 返回:
- self对自身的引用(参数设置后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[来源]#
为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
self.get_params
找到名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
派生的整数。这些整数通过链式哈希(sample_dependent_seed
)采样,并保证伪随机独立性,适用于种子随机生成器。根据
self_policy
应用于self
中的random_state
参数,并且仅当deep=True
时应用于剩余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者任何组件都没有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是那些没有random_state
参数的对象。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None,默认值=None
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递 int 可在多次函数调用中获得可重现的输出。
- **deep**bool, 默认值=True
是否在值为 skbase 对象的参数中设置随机状态,即组件估计器。
如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则也会在组件对象中设置
random_state
参数。
- self_policystr,以下之一:{"copy", "keep", "new"},默认值="copy"
“copy” :
self.random_state
被设置为输入的random_state
“keep” :
self.random_state
保持不变“new” :
self.random_state
被设置为一个新的随机状态,
从输入的
random_state
派生,通常与它不同
- 返回:
- self对自身的引用
- set_tags(**tag_dict)[来源]#
将实例级别标签覆盖设置为给定值。
每个与
scikit-base
兼容的对象都有一个标签字典,用于存储有关对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要将标签设置为的值。set_tags
方法只能在对象的__init__
方法中调用,即在构造期间或通过__init__
直接构造之后。当前的标签值可以通过
get_tags
或get_tag
进行检查。- 参数:
- **tag_dict字典
标签名称:标签值对的字典。
- 返回:
- 自身
对自身的引用。