AlignerLuckyDtw#

class AlignerLuckyDtw(window=None)[source]#

基于幸运动态时间规整距离的对齐路径。

此对齐器返回幸运时间规整距离 [1]_ 生成的对齐路径。对多元数据使用欧氏距离。

基于 Krisztian A Buza 研究组的代码。

参数:
window: int, 可选 (默认值=None)

对齐序列索引之间的最大距离,也称为规整窗口。如果为 None,则默认为 max(len(ts1), len(ts2)),即无规整窗口。

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

参考文献

..[1] Stephan Spiegel, Brijnesh-Johannes Jain, and Sahin Albayrak.

基于幸运时间规整距离的快速时间序列分类。Proceedings of the 29th Annual ACM Symposium on Applied Computing. 2014.

方法

check_is_fitted([method_name])

检查估计器是否已拟合。

clone()

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

使用第一个测试参数集构造类的实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例列表及其名称列表。

fit(X[, Z])

给定要对齐的序列,拟合对齐。

get_aligned()

返回传递给 fit 的序列的对齐版本。

get_alignment()

返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (iloc 索引)。

get_alignment_loc()

返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (loc 索引)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

get_class_tags()

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

get_config()

获取 self 的配置标志。

get_distance()

返回对齐的整体距离。

get_distance_matrix()

返回对齐的距离矩阵。

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的默认参数。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

get_tags()

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObject 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化内存容器加载对象。

reset()

将对象重置为干净的初始化后状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的 self 保存到字节类似对象或 (.zip) 文件。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
**parameter_set**str, 默认值=”default”

返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回 "default" 集。目前没有为对齐器保留的值。

返回:
**params**dict 或 dict 列表, 默认值 = {}

用于创建类的测试实例的参数。每个 dict 都是构造一个“有趣”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典。

check_is_fitted(method_name=None)[source]#

检查估计器是否已拟合。

检查 _is_fitted 属性是否存在且为 Trueis_fitted 属性应在调用对象的 fit 方法时设置为 True

如果不是,则引发 NotFittedError

参数:
**method_name**str, 可选

调用此方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[source]#

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

克隆是一个没有共享引用的不同对象,处于初始化后状态。此函数等同于返回 selfsklearn.clone

等同于使用 self 的参数构造 type(self) 的新实例,即 type(self)(**self.get_params(deep=False))

如果在 self 上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用 cloned_self.set_config(**self.get_config())

在值上也等同于调用 self.reset,但例外是 clone 返回一个新对象,而不是像 reset 那样改变 self

引发:
如果由于错误的 __init__ 导致克隆不符合规范,则引发 RuntimeError。
clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

clone_tags 从另一个对象 estimator 设置动态标签覆盖。

clone_tags 方法只能在对象的 __init__ 方法中调用,在构造期间,或在通过 __init__ 构造后直接调用。

动态标签设置为 estimator 中标签的值,名称在 tag_names 中指定。

tag_names 的默认值将 estimator 中的所有标签写入 self

当前的标签值可以通过 get_tagsget_tag 进行检查。

参数:
**estimator**:class:BaseObject 或派生类的实例
**tag_names**str 或 str 列表, 默认值 = None

要克隆的标签名称。默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签。

返回:
self

self 的引用。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#

使用第一个测试参数集构造类的实例。

参数:
**parameter_set**str, 默认值=”default”

返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
**instance**具有默认参数的类的实例
classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#

创建所有测试实例列表及其名称列表。

参数:
**parameter_set**str, 默认值=”default”

返回用于测试的测试参数集的名称。如果未为值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
**objs**cls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

**names**str 列表, 长度与 objs 相同

第 i 个元素是测试中 obj 第 i 个实例的名称。如果实例多于一个,命名约定为 {cls.__name__}-{i},否则为 {cls.__name__}

fit(X, Z=None)[source]#

给定要对齐的序列,拟合对齐。

状态变化

将状态更改为“已拟合”。

写入 self

将 self._is_fitted 标志设置为 True。将 XZ 分别存储到 self._X 和 self._Z。设置以“_”结尾的拟合模型属性。

参数:
**X**长度为 n 的 pd.DataFrame (Series) 列表

要对齐的时间序列集合

**Z**具有 n 行的 pd.DataFrame, 可选

元数据,Z 的第 i 行对应于 X 的第 i 个元素

get_aligned()[source]#

返回传递给 fit 的序列的对齐版本。

行为: 返回传递给 fit 的 X 中未对齐序列的对齐版本

模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取

所需状态

需要状态为“已拟合”。

访问 self

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
X_aligned_list: 序列格式的 pd.DataFrame 列表

长度为 n,索引对应于传递给 fit 的 X 的索引 第 i 个元素是重新索引的,X[i] 的对齐版本

get_alignment()[source]#

返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (iloc 索引)。

行为: 返回传递给 fit 的 X 中序列的对齐

模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取

所需状态

需要状态为“已拟合”。

访问 self

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) (其中 i 为整数)

列包含 X[i] 的 iloc 索引映射到对齐坐标

get_alignment_loc()[source]#

返回传递给 fit 的序列/时间序列的对齐 (loc 索引)。

行为: 返回传递给 fit 的 X 中序列的对齐

模型应处于已拟合状态,拟合模型参数从 self 读取

所需状态

需要状态为“已拟合”。

访问 self

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) (其中 i 为整数)

列包含 X[i] 的 loc 索引映射到对齐坐标

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#

从类中获取类标签值,并从父类继承标签级别。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典,用于存储有关对象的元数据。

get_class_tag 方法是类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。

它从对象中返回名称为 tag_name 的标签值,考虑了标签覆盖,优先级降序排列如下

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要检索具有潜在实例覆盖的标签值,请改用 get_tag 方法。

参数:
**tag_name**str

标签值的名称。

**tag_value_default**任意类型

如果找不到标签,则为默认/回退值。

返回:
tag_value

selftag_name 标签的值。如果找不到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[source]#

从类中获取类标签,并从父类继承标签级别。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_class_tags 方法是类方法,仅考虑类级别标签值和覆盖来检索标签的值。

它返回一个字典,键是类或其任何父类中设置的 _tags 任何属性的键。

值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

实例可以根据超参数覆盖这些标签。

要检索具有潜在实例覆盖的标签,请改用 get_tags 方法。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要包含来自动态标签的覆盖,请使用 get_tags

collected_tagsdict

标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集。不会被 set_tagsclone_tags 设置的动态标签覆盖。

get_config()[source]#

获取 self 的配置标志。

Configs 是 self 的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。

get_config 返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。

默认配置在类或其父类的 _config 类属性中设置,并通过 set_config 设置的动态配置覆盖。

Configs 在 clonereset 调用下保留。

返回:
**config_dict**dict

配置名称 : 配置值 对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_distance()[source]#

返回对齐的整体距离。

行为: 返回与对齐对应的整体距离

并非所有对齐器都会返回或实现此功能(可选)

所需状态

需要状态为“已拟合”。

访问 self

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
distance: float - 传递给 fit 的 X 的所有元素之间的整体距离
get_distance_matrix()[source]#

返回对齐的距离矩阵。

行为: 返回对齐距离的成对距离矩阵

并非所有对齐器都会返回或实现此功能(可选)

所需状态

需要状态为“已拟合”。

访问 self

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
distmat: 一个 (n x n) np.array (浮点数),其中 n 是传递给 fit 的 X 的长度

[i,j] 项是传递给 fit 的 X[i] 和 X[j] 之间的对齐距离

get_fitted_params(deep=True)[source]#

获取拟合参数。

所需状态

需要状态为“已拟合”。

参数:
**deep**bool, 默认值=True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值 字典,包括可拟合组件 (= BaseEstimator 类型参数) 的拟合参数。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值 字典,但不包括组件的拟合参数。

返回:
**fitted_params**str 键的 dict

拟合参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对

  • 总是: 此对象的所有拟合参数,如通过 get_param_names 获取,值是此对象该键的拟合参数值

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对。组件参数以 [componentname]__[paramname] 形式索引,componentname 的所有参数以 paramname 形式出现,带有其值

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

classmethod get_param_defaults()[source]#

获取对象的默认参数。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数。值是在 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[source]#

获取对象的参数名称。

参数:
**sort**bool, 默认值=True

是否按字母顺序 (True) 或按它们在类 __init__ 中出现的顺序 (False) 返回参数名称。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,按它们在类 __init__ 中出现的相同顺序排列。如果 sort=True,按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[source]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
**deep**bool, 默认值=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值 的 dict,包括组件 (= BaseObject 类型参数) 的参数。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值 的 dict,但不包括组件的参数。

返回:
**params**str 键的 dict

参数字典,包含 paramname : paramvalue 键值对

  • 总是: 此对象的所有参数,如通过 get_param_names 获取,值是此对象该键的参数值。值始终与构造时传递的值相同

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对。组件参数以 [componentname]__[paramname] 形式索引,componentname 的所有参数以 paramname 形式出现,带有其值

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tag 方法从实例中检索名称为 tag_name 的单个标签的值,考虑了标签覆盖,优先级降序排列如下

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

参数:
**tag_name**str

要检索的标签名称

**tag_value_default**任意类型, 可选; 默认值=None

如果找不到标签,则为默认/回退值

**raise_error**bool

找不到标签时是否引发 ValueError

返回:
**tag_value**Any

selftag_name 标签的值。如果找不到,并且 raise_error 为 True,则引发错误,否则返回 tag_value_default

引发:
ValueError,如果 raise_errorTrue

如果 tag_name 不在 self.get_tags().keys() 中,则引发 ValueError

get_tags()[source]#

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典。标签可用于存储有关对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tags 方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 的任何属性的键,或者通过 set_tagsclone_tags 设置的标签。

值是相应的标签值,覆盖优先级降序排列如下

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

返回:
**collected_tags**dict

标签名称 : 标签值 对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集,然后是来自 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

is_composite()[source]#

检查对象是否由其他 BaseObject 组成。

复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

对象是否有任何参数的值是 BaseObject 的后代实例。

property is_fitted[source]#

是否已调用 fit

检查对象的 _is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为 ``False,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。

返回:
bool

估计器是否已 fit

classmethod load_from_path(serial)[source]#

从文件位置加载对象。

参数:
**serial**ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化的 self,产生 cls.save(path)path 处的输出
classmethod load_from_serial(serial)[source]#

从序列化内存容器加载对象。

参数:
**serial**cls.save(None) 输出的第 1 个元素
返回:
反序列化的 self,产生 cls.save(None) 的输出 serial
reset()[source]#

将对象重置为干净的初始化后状态。

结果是将 self 设置回构造函数调用后的状态,并保持相同的超参数。set_config 设置的配置值也会保留。

reset 调用会删除任何对象属性,除了

  • 超参数 = __init__ 的参数,写入 self,例如 self.paramname,其中 paramname__init__ 的一个参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性将被保留。

  • 配置属性,配置保持不变。也就是说,reset 前后 get_config 的结果是相等的。

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

等同于 clone,但例外是 reset 改变 self 而不是返回一个新对象。

在调用 self.reset() 后,self 在值和状态上与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。

返回:
self

类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前超参数值。

save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#

将序列化的 self 保存到字节类似对象或 (.zip) 文件。

行为: 如果 path 为 None,则返回内存中序列化的 self;如果 path 是文件位置,则将 self 以 zip 文件形式存储在该位置

保存的文件是 zip 文件,包含以下内容: _metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认序列化(pickle)。

参数:
**path**None 或文件位置 (str 或 Path)

如果为 None,self 保存到内存对象;如果是文件位置,self 保存到该文件位置。如果

  • path=”estimator”,则会在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件 estimator.zip

  • path=”/home/stored/estimator”,则会在 /home/stored/ 存储一个 zip 文件 estimator.zip

存储在 /home/stored/ 中。

serialization_format: str, 默认值 = “pickle”

用于序列化的模块。可用选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的 self
如果 path 是文件位置 - 指向文件的 ZipFile
set_config(**config_dict)[source]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
**config_dict**dict

配置名称 : 配置值 对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示

**display**str, “diagram”(默认)或“text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 框图表示

  • “text” = 字符串打印输出

**print_changed_only**bool, 默认值=True

打印 self 时,是只列出与默认值不同的 self 参数 (False),还是列出所有参数名称和值 (False)。不进行嵌套,即仅影响 self,不影响组件估计器。

**warnings**str, “on”(默认)或“off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 将不引发来自 sktime 的警告

**backend:parallel**str, 可选, 默认值=”None”

广播/向量化时用于并行化的后端,可选值之一为

  • “None”: 顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”: 使用 dask,需要在环境中安装 dask

  • “ray”: 使用 ray,需要在环境中安装 ray

**backend:parallel:params**dict, 可选, 默认值={}(未传递参数)

作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于 backend:parallel 的值

  • “None”: 没有附加参数,backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” and “threading”:默认的 joblib 后端,joblib.Parallel 的任何有效键都可以在此处传递,例如 n_jobs,除了 backend,它由 backend 直接控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 sparkjoblib.Parallel 的任何有效键都可以在此处传递,例如 n_jobs。在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”:可以传递 dask.compute 的任何有效键,例如 scheduler

  • “ray”:可以传递以下键

    • “ray_remote_args”:ray.init 的有效键字典

    • “shutdown_ray”:bool,默认值=True;False 可防止 ray

      在并行化后关闭。

    • “logger_name”:str,默认值=”ray”;要使用的记录器名称。

    • “mute_warnings”:bool,默认值=False;如果为 True,则禁止警告

返回:
self对自身的引用。

注意

改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[来源]#

设置此对象的参数。

此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串 <component>__<parameter> 可用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果引用明确无歧义,例如没有两个组件参数的名称相同,则也可以使用字符串 <parameter>,不带 <component>__

参数:
**params字典

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。如果 __ 后缀在 get_params 键中是唯一的,则可以作为完整字符串的别名。

返回:
self对自身的引用(参数设置后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[来源]#

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 self.get_params 找到名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为从 random_state 派生的整数。这些整数通过链式哈希(sample_dependent_seed)采样,并保证伪随机独立性,适用于种子随机生成器。

根据 self_policy 应用于 self 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时应用于剩余组件对象。

注意:即使 self 没有 random_state 参数,或者任何组件都没有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 对象,即使是那些没有 random_state 参数的对象。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None,默认值=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递 int 可在多次函数调用中获得可重现的输出。

**deep**bool, 默认值=True

是否在值为 skbase 对象的参数中设置随机状态,即组件估计器。

  • 如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。

  • 如果为 True,则也会在组件对象中设置 random_state 参数。

self_policystr,以下之一:{"copy", "keep", "new"},默认值="copy"
  • “copy” :self.random_state 被设置为输入的 random_state

  • “keep” :self.random_state 保持不变

  • “new” :self.random_state 被设置为一个新的随机状态,

从输入的 random_state 派生,通常与它不同

返回:
self对自身的引用
set_tags(**tag_dict)[来源]#

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

每个与 scikit-base 兼容的对象都有一个标签字典,用于存储有关对象的元数据。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。

set_tags 将动态标签覆盖设置为 tag_dict 中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要将标签设置为的值。

set_tags 方法只能在对象的 __init__ 方法中调用,即在构造期间或通过 __init__ 直接构造之后。

当前的标签值可以通过 get_tagsget_tag 进行检查。

参数:
**tag_dict字典

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自身

对自身的引用。