FlatDist#
- class FlatDist(transformer)[source]#
通过对展平的时间序列应用表格变换获得的面板距离或核函数。
将封装的表格距离或核函数应用于展平的时间序列。展平是将时间序列转换为形状为 (n_instances, (n_vars, n_timepts)) 的二维 numpy 数组。
形式化细节(对于实值对象,混合类型行以此类推):令 \(d:\mathbb{R}^k \times \mathbb{R}^{k}\rightarrow \mathbb{R}\) 是
transformer
中的成对函数,当应用于k
向量时(此处,\(d\) 可以是距离函数或核函数)。令 \(x_1, \dots, x_N\in \mathbb{R}^{n \times \ell}\), \(y_1, \dots y_M \in \mathbb{R}^{n \times \ell}\) 为矩阵集合,表示时间序列面板值输入X
和X2
,如下所示:\(x_i\) 是X
中的第i
个实例,\(x_{i, j\ell}\) 是X
的第j
个时间点、第\ell
个变量。对于 \(y\) 和X2
同理。令 \(f:\mathbb{R}^{n \times \ell} \rightarrow \mathbb{R}^{n \cdot \ell}\) 是按列优先字典序展平矩阵的映射,并假设 \(k = n \cdot \ell\)。然后,
transform(X, X2)
返回一个 \((N \times M)\) 矩阵,其 \((i, j)\) 项为 \(d\left(f(x_i), f(y_j)\right)\)。- 参数:
- transformer: scitype 为 BasePairwiseTransformer 的成对变换器,或
callable np.ndarray (n_samples, d) x (n_samples, d) -> (n_samples x n_samples)
- 属性:
is_fitted
是否已调用
fit
方法。
示例
等长时序之间的欧几里得距离,将其视为向量
>>> from sktime.dists_kernels import FlatDist, ScipyDist >>> euc_tsdist = FlatDist(ScipyDist())
等长时序之间的 Gaussian 核函数,将其视为向量
>>> from sklearn.gaussian_process.kernels import RBF >>> flat_gaussian_tskernel = FlatDist(RBF())
方法
__call__
(X[, X2])计算距离/核函数矩阵,调用简写。
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
clone
()获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构建类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表及其对应的名称列表。
fit
([X, X2])用于接口兼容性的拟合方法(内部无逻辑)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,包括从父类继承的标签级别。
从类中获取类标签,包括从父类继承的标签级别。
获取对象的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取已拟合参数。
获取对象的默认参数。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例获取标签值,包括标签级别的继承和覆盖。
get_tags
()从实例获取标签,包括标签级别的继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])FlatDist 的测试参数。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
reset
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的对象保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为对象设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级标签覆盖设置为给定值。
transform
(X[, X2])计算距离/核函数矩阵。
计算距离/核函数矩阵的对角线。
- check_is_fitted(method_name=None)[source]#
检查估计器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。应在调用对象的fit
方法时将is_fitted
属性设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr, 可选
调用此方法的函数的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[source]#
获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
克隆是另一个没有共享引用、处于初始化后状态的对象。此函数等同于返回
self
的sklearn.clone
。等同于构造
type(self)
的新实例,使用self
的参数,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。其值也等同于调用
self.reset
,但clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样修改self
。- 引发:
- 如果克隆由于错误的
__init__
而不符合要求,则引发 RuntimeError。
- 如果克隆由于错误的
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都带有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。clone_tags
从另一个对象 (estimator
) 设置动态标签覆盖。仅应在对象的
__init__
方法中、构造期间,或在构造后通过__init__
直接调用clone_tags
方法。动态标签设置为
estimator
中标签的值,名称在tag_names
中指定。tag_names
的默认行为是将estimator
中的所有标签写入self
。当前标签值可通过
get_tags
或get_tag
查看。estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- parameter_setstr, 默认=”default”
使用第一个测试参数集构建类的实例。
- objs类实例列表
创建所有测试实例的列表及其对应的名称列表。
-
每个
scikit-base
兼容对象都带有一个标签字典,用于存储对象的元数据。 从类中获取类标签值,包括从父类继承的标签级别。
get_class_tag
方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它从对象中返回名称为
tag_name
的标签的值,考虑标签覆盖,按以下降序优先级:在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖,这些覆盖定义在实例上。要检索可能包含实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。tag_namestr
-
get_class_tags
方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。 从类中获取类标签,包括从父类继承的标签级别。
每个
scikit-base
兼容对象都带有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。clone_tags
从另一个对象 (estimator
) 设置动态标签覆盖。它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的
_tags
的任何属性的键。值是相应的标签值,按以下降序优先级进行覆盖:
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
在父类的
_tags
属性中设置的标签,按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖,这些覆盖定义在实例上。要检索可能包含实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。要包含来自动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。要检索可能包含实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。collected_tagsdict
-
配置是
self
的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。 获取对象的配置标志。
get_config
返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。默认配置在类或其父类的
_config
类属性中设置,并被通过set_config
设置的动态配置覆盖。配置在
clone
或reset
调用中得以保留。config_dictdict
- 所需状态
获取已拟合参数。
- 要求状态为“已拟合”(”fitted“)。
deepbool, 默认=True
- 参数:
- 是否返回组件的已拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值字典,包括可拟合组件(即 BaseEstimator 值的参数)的已拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值字典,但不包括组件的已拟合参数。
fitted_params键为字符串的字典
- self
- 已拟合参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括
始终:此对象的所有已拟合参数,如通过
get_param_names
获取,值是该键对应的此对象的已拟合参数值
- 获取对象的默认参数。
default_dict: dict[str, Any]
- 获取对象的参数名称。
sortbool, 默认=True
- 是否返回组件的参数。
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- 是否返回组件的已拟合参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名 : 值dict
,包括组件(=BaseObject
值的参数)的参数。如果为
False
,将返回此对象的参数名 : 值dict
,但不包括组件的参数。params键为字符串的字典
- self
-
get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签的值,考虑标签覆盖,按以下降序优先级: 从实例获取标签值,包括标签级别的继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都带有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。clone_tags
从另一个对象 (estimator
) 设置动态标签覆盖。通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,在实例构建时。
要检索的标签名称
在父类的
_tags
属性中设置的标签,按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖,这些覆盖定义在实例上。- 参数:
- 标签值的名称。
tag_value_default任何类型, 可选;默认=None
- 如果找不到标签,则使用的默认/回退值
raise_errorbool
- 在找不到标签时是否引发
ValueError
tag_valueAny
- self
self
中tag_name
标签的值。如果找不到,并且raise_error
为 True,则引发错误;否则返回tag_value_default
。ValueError, 如果
raise_error
为True
。
- 引发:
-
get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
的任何属性的键,或通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。 从实例获取标签,包括标签级别的继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都带有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据或控制对象的行为。clone_tags
从另一个对象 (estimator
) 设置动态标签覆盖。collected_tagsdict
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
在实例构建时。
要检索的标签名称
在父类的
_tags
属性中设置的标签,按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖,这些覆盖定义在实例上。
- 复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
composite: bool
-
检查对象的
_is_fitted` 属性,该属性在对象构建期间应初始化为 ``False
,并在调用对象的 `fit` 方法时设置为 True。 是否已调用
fit
方法。bool
- serialZipFile(path).open(“object) 的结果
从文件位置加载对象。
-
serial
cls.save(None)
输出的第一个元素 从序列化内存容器加载对象。
-
结果是将
self
设置为构造函数调用后的状态,具有相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也会保留。 将对象重置为干净的初始化后状态。
reset
调用会删除任何对象属性,但以下情况除外超参数 = 写入
self
的__init__
参数,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的参数包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,保留名为“__myattr”的属性。
配置属性,配置保持不变。也就是说,
reset
前后get_config
的结果是相同的。类和对象方法以及类属性也不受影响。
等同于
clone
,但reset
修改self
而不是返回一个新对象。在调用
self.reset()
后,self
的值和状态等同于构造函数调用``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象。类的实例被重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
-
行为:如果
path
为 None,返回一个内存中的序列化对象;如果path
是文件位置,则将对象在该位置存储为 zip 文件 将序列化的对象保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
保存的文件是 zip 文件,包含以下内容: _metadata - 包含对象所属的类,即 type(self) _obj - 序列化的对象。此类使用默认序列化 (pickle)。
pathNone 或文件位置 (字符串或 Path)
- 参数:
- 如果为 None,对象保存到内存中;如果为文件位置,对象保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则在当前工作目录创建
estimator.zip
zip 文件。path=”/home/stored/estimator”,则
estimator.zip
zip 文件将保存到存储在
/home/stored/
中。
serialization_format: str, 默认 = “pickle”
- 用于序列化的模块。可用选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
如果
path
为 None - 内存中的序列化对象
- self
- 配置名 : 配置值对的字典。有效配置、值及其含义如下所示:
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- 配置名 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
displaystr, “diagram”(默认)或“text”
- jupyter kernel 如何显示对象实例
“diagram” = html 框图表示
“text” = 字符串打印输出
print_changed_onlybool, 默认=True
- 打印对象时是仅列出与默认值不同的参数 (False),还是列出所有参数名称和值 (False)。不进行嵌套,即仅影响对象本身,而不影响组件估计器。
warningsstr, “on”(默认)或“off”
- 是否引发警告,仅影响 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 不会引发来自 sktime 的警告
backend:parallelstr, 可选, 默认=”None”
- 广播/向量化时用于并行化的后端,以下之一
“None”:按顺序执行循环,简单的列表推导式
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”:使用
dask
,需要环境中包含dask
包“ray”:使用
ray
,需要环境中包含ray
包backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={}(不传递参数)
- 作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值 “None”:无附加参数,忽略
backend_params
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的
joblib
后端,此处可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,但backend
除外,它直接由backend
控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。此处可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,在这种情况下,必须将backend
作为backend_params
的一个键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“dask”:可以传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”:可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典“shutdown_ray”:布尔值,默认=True;False 防止
ray
- 在并行化后关闭。
“logger_name”:字符串,默认=”ray”;要使用的 logger 名称。
“mute_warnings”:布尔值,默认=False;如果为 True,则抑制警告
self对象的引用。
- self
- 注意
更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
-
该方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>
可用于复合对象(即包含其他对象的对象),以访问组件<component>
中的<parameter>
。如果这使得引用明确(例如,没有两个组件参数同名为<parameter>
),也可以使用不带<component>__
的字符串<parameter>
。 设置此对象的参数。
**paramsdict
-
通过
self.get_params
找到名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。 为对象设置 random_state 伪随机种子参数。
根据
self_policy
应用于self
中的random_state
参数,并且仅当deep=True
时应用于剩余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者任何组件都没有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是那些没有random_state
参数的对象。random_state整数, RandomState 实例或 None, 默认=None
- 参数:
- 用于控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递整数以实现多次函数调用之间可复现的输出。
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传入整型数以在多次函数调用中获得可重现的输出。
- 是否返回组件的已拟合参数。
是否在具有 skbase 对象值的参数中设置随机状态,即组件估计器。
如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则也会在组件对象中设置
random_state
参数。
- self_policystr, 以下之一 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认为 “copy”
“copy” : 将
self.random_state
设置为输入的random_state
“keep” :
self.random_state
保持不变“new” : 将
self.random_state
设置为一个新的随机状态,
该状态派生自输入的
random_state
,并且通常与它不同
- self
- self对自身的引用
- set_tags(**tag_dict)[来源]#
将实例级标签覆盖设置为给定值。
get_class_tag
方法是一个类方法,仅考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是静态标志,在对象构建后不会改变。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要设置的标签值。set_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中,在构建期间,或在通过__init__
构建后直接调用。estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- 参数:
- **tag_dictdict
标签名称: 标签值 对的字典。
- self
- Self
对自身的引用。
- transform(X, X2=None)[来源]#
计算距离/核函数矩阵。
- 行为:返回成对距离/核矩阵
X 和 X2 中的样本之间(如果 X2 未传入,则 X2 等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 m 个实例
可选,默认为:X = X2
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
X 和 X2 不需要具有相同的 mtype
- self
- distmat: np.array of shape [n, m]
第 (i,j) 个条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[来源]#
计算距离/核函数矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,Python 类型如下
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 带有两级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame, 或 long/wide 格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- self
- diag: np.array of shape [n]
第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核