AggrDist#

class AggrDist(transformer, aggfunc=None, aggfunc_is_symm=False)[source]#

来自表格距离聚合的面板距离。

通过对表格距离矩阵应用聚合函数获得的面板距离

示例:AggrDist(ScipyDist()) 是序列之间的平均欧几里得距离

形式化细节(对于实值对象,混合类型行同理):设 \(d: \mathbb{R}^k \times \mathbb{R}^{k}\rightarrow \mathbb{R}\) 是应用于 k 向量时,transformer 中的成对函数。设 \(f:\mathbb{R}^{n \ times m}\) 是应用于 \((n \times m)\) 矩阵时的函数 aggfunc。设 \(x_1, \dots, x_N\in \mathbb{R}^{n \times k}\), \(y_1, \dots y_M \in \mathbb{R}^{m \times k}\) 是矩阵集合,表示时间序列面板值输入 XX2,如下所示:\(x_i\)X 中的第 i 个实例,\(x_{i, j\ell}\)X 的第 j 个时间点、第 \ell 个变量。对于 \(y\)X2 同理。

然后,transform(X, X2) 返回一个 \((N \times M)\) 矩阵,其第 \((i, j)\) 个条目为 \(f \left((d(x_{i, a}, y_{j, b}))_{a, b}\right)\),其中 \(x_{i, a}\) 表示 \(x_i\) 的第 \(a\) 行,\(y_{j, b}\) 表示 \(x_j\) 的第 \(b\) 行。

参数:
transformer: BasePairwiseTransformer scitype 的成对转换器
aggfunc: 聚合函数 (2D np.array) -> float 或 None,可选

默认值 = None = np.mean

aggfunc_is_symm: 布尔值,可选,默认值=False
聚合函数是否对称(应根据 aggfunc 设置)
即,参数转置后不变,始终满足

aggfunc(matrix) = aggfunc(np.transpose(matrix))

用于快速计算结果矩阵(如果对称)如果未知,False 是确保正确性的“安全”选项

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

示例

时间序列之间的平均成对欧几里得距离

>>> from sktime.dists_kernels import AggrDist, ScipyDist
>>> mean_euc_tsdist = AggrDist(ScipyDist())

时间序列之间的平均成对高斯核

>>> from sklearn.gaussian_process.kernels import RBF
>>> mean_gaussian_tskernel = AggrDist(RBF())

方法

__call__(X[, X2])

计算距离/核矩阵,调用简写。

check_is_fitted([method_name])

检查估计器是否已拟合。

clone()

获取具有相同超参数和配置的对象克隆。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

使用第一个测试参数集构造类的实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例列表及其名称列表。

fit([X, X2])

用于接口兼容性的 fit 方法(内部无逻辑)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

从类中获取类标签值,具有来自父类的标签级别继承。

get_class_tags()

从类中获取类标签,具有来自父类的标签级别继承。

get_config()

获取 self 的配置标志。

get_fitted_params([deep])

获取已拟合的参数。

get_param_defaults()

获取对象的默认参数。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

get_tags()

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

get_test_params([parameter_set])

AggrDist 的测试参数。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObject 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化内存容器加载对象。

reset()

将对象重置为干净的初始化后状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的 self 保存到字节类对象或 (.zip) 文件。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

transform(X[, X2])

计算距离/核矩阵。

transform_diag(X)

计算距离/核矩阵的对角线。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#

AggrDist 的测试参数。

check_is_fitted(method_name=None)[source]#

检查估计器是否已拟合。

检查 _is_fitted 属性是否存在且为 Trueis_fitted 属性应在调用对象的 fit 方法时设置为 True

如果不是,则引发 NotFittedError

参数:
method_namestr,可选

调用此方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[source]#

获取具有相同超参数和配置的对象克隆。

克隆是另一个不共享引用、处于初始化后状态的对象。此函数等同于返回 sklearn.cloneself

等同于使用 self 的参数构造 type(self) 的新实例,即 type(self)(**self.get_params(deep=False))

如果在 self 上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用 cloned_self.set_config(**self.get_config())

在值上也等同于调用 self.reset,不同之处在于 clone 返回一个新对象,而不是像 reset 那样改变 self

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 错误,则引发 RuntimeError。
clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

clone_tags 从另一个对象 estimator 设置动态标签覆盖。

clone_tags 方法应仅在对象的 __init__ 方法中调用,在构造期间或通过 __init__ 直接在构造后调用。

动态标签被设置为 estimator 中标签的值,其名称在 tag_names 中指定。

tag_names 的默认值是将 estimator 中的所有标签写入 self

当前标签值可以通过 get_tagsget_tag 进行检查。

参数:
estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
tag_namesstr 或 str 列表,默认值 = None

要克隆的标签名称。默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签。

返回:
self

self 的引用。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#

使用第一个测试参数集构造类的实例。

参数:
parameter_setstr,默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,则将返回 “default” 集。

返回:
instance具有默认参数的类实例
classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#

创建所有测试实例列表及其名称列表。

参数:
parameter_setstr,默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,则将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

namesstr 列表,长度与 objs 相同

第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称。如果实例不止一个,命名约定为 {cls.__name__}-{i},否则为 {cls.__name__}

fit(X=None, X2=None)[source]#

用于接口兼容性的 fit 方法(内部无逻辑)。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#

从类中获取类标签值,具有来自父类的标签级别继承。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。

get_class_tag 方法是一个类方法,检索标签值时仅考虑类级别标签值和覆盖。

它从对象中返回名称为 tag_name 的标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要检索可能包含实例覆盖的标签值,请改用 get_tag 方法。

参数:
tag_namestr

标签值的名称。

tag_value_default任意类型

如果未找到标签,则为默认/回退值。

返回:
tag_value

selftag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[source]#

从类中获取类标签,具有来自父类的标签级别继承。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_class_tags 方法是一个类方法,检索标签值时仅考虑类级别标签值和覆盖。

它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 的任何属性的键。

值是对应的标签值,覆盖优先级降序如下

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

实例可以根据超参数覆盖这些标签。

要检索可能包含实例覆盖的标签,请改用 get_tags 方法。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要包含来自动态标签的覆盖,请使用 get_tags

collected_tagsdict

标签名 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集。不会被通过 set_tagsclone_tags 设置的动态标签覆盖。

get_config()[source]#

获取 self 的配置标志。

配置是 self 的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。

get_config 返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。

默认配置在类或其父类的类属性 _config 中设置,并被通过 set_config 设置的动态配置覆盖。

clonereset 调用下保留配置。

返回:
config_dictdict

配置名 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后从 _onfig_dynamic 对象属性收集任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[source]#

获取已拟合的参数。

所需状态

要求状态为“拟合”。

参数:
deep布尔值,默认值=True

是否返回组件的已拟合参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 值参数)的已拟合参数。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值字典,但不包括组件的已拟合参数。

返回:
fitted_params键为 str 的 dict

已拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有已拟合参数,如通过 get_param_names 获取,值是此对象该键的已拟合参数值

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键值对,组件参数的索引格式为 [componentname]__[paramname]componentname 的所有参数都以 paramname 及其值出现

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

classmethod get_param_defaults()[source]#

获取对象的默认参数。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls__init__ 中定义了默认值的所有参数。值是默认值,如在 __init__ 中定义的。

classmethod get_param_names(sort=True)[source]#

获取对象的参数名称。

参数:
sort布尔值,默认值=True

是按字母顺序(True)还是按它们在类 __init__ 中出现的顺序(False)返回参数名称。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,顺序与它们在类 __init__ 中出现的顺序相同。如果 sort=True,按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[source]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
deep布尔值,默认值=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值 dict,包括组件(= BaseObject 值参数)的参数。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值 dict,但不包括组件的参数。

返回:
params键为 str 的 dict

参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有参数,如通过 get_param_names 获取,值是此对象该键的参数值,值始终与构造时传递的值相同

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键值对,组件参数的索引格式为 [componentname]__[paramname]componentname 的所有参数都以 paramname 及其值出现

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#

从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_tag 方法从实例中检索名称为 tag_name 的单个标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

参数:
tag_namestr

要检索的标签名称

tag_value_default任意类型,可选;默认值=None

如果未找到标签,则为默认/回退值

raise_error布尔值

未找到标签时是否引发 ValueError

返回:
tag_value任意

selftag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时引发错误,否则返回 tag_value_default

引发:
ValueError,如果 raise_errorTrue

如果 tag_name 不在 self.get_tags().keys() 中,则引发 ValueError

get_tags()[source]#

从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。

get_tags 方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 的任何属性的键,或通过 set_tagsclone_tags 设置的标签。

值是对应的标签值,覆盖优先级降序如下

  1. 通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

返回:
collected_tagsdict

标签名 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性收集任何覆盖和新标签。

is_composite()[source]#

检查对象是否由其他 BaseObject 组成。

复合对象是包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: 布尔值

对象是否有任何参数,其值是 BaseObject 后代实例。

property is_fitted[source]#

是否已调用 fit

检查对象的 _is_fitted` 属性,该属性应在对象构造期间初始化为 ``False,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。

返回:
布尔值

估计器是否已 fit

classmethod load_from_path(serial)[source]#

从文件位置加载对象。

参数:
serialresult of ZipFile(path).open(“object)
返回:
反序列化的 self,结果输出到 path,来自 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[source]#

从序列化内存容器加载对象。

参数:
serialcls.save(None) 输出的第 1 个元素
返回:
反序列化的 self,结果输出 serial,来自 cls.save(None)
reset()[source]#

将对象重置为干净的初始化后状态。

结果是将 self 设置为构造函数调用后立即拥有的状态,具有相同的超参数。通过 set_config 设置的配置值也会被保留。

一个 reset 调用会删除任何对象属性,除了

  • 超参数 = 写入 self__init__ 的参数,例如 self.paramname,其中 paramname__init__ 的一个参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性会被保留。

  • 配置属性,配置会保留不变。即,reset 前后 get_config 的结果相等。

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

等同于 clone,不同之处在于 reset 改变 self 而不是返回一个新对象。

调用 self.reset() 后,self 在值和状态上与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。

返回:
self

类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前超参数值。

save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#

将序列化的 self 保存到字节类对象或 (.zip) 文件。

行为:如果 path 为 None,返回内存中的序列化 self;如果 path 是文件位置,则在该位置将 self 保存为 zip 文件

保存的文件是 zip 文件,包含以下内容:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方式 (pickle)。

参数:
pathNone 或文件位置 (str 或 Path)

如果为 None,self 保存到内存对象;如果是文件位置,self 保存到该文件位置。如果

  • path=”estimator”,则将在当前工作目录创建 zip 文件 estimator.zip

  • path=”/home/stored/estimator”,则 zip 文件 estimator.zip 将被

存储在 /home/stored/ 中。

serialization_format: str,默认值 = “pickle”

用于序列化的模块。可用选项包括“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回:
如果 path 为 None - 内存中的序列化 self
如果 path 是文件位置 - ZipFile,引用该文件
set_config(**config_dict)[source]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名 : 配置值对的字典。有效配置、值及其含义如下所示

displaystr,“diagram”(默认值),或“text”

jupyter kernel 如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 框图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_only布尔值,默认值=True

打印 self 时是仅列出与默认值不同的 self 参数(False),还是列出所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响 self 而不影响组件估计器。

warningsstr,“on”(默认值),或“off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 将不引发来自 sktime 的警告

backend:parallelstr,可选,默认值=”None”

用于广播/向量化时的并行化后端,以下之一:

  • “None”:顺序执行循环,简单的列表推导式

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”:使用 dask,需要环境中安装 dask

  • “ray”:使用 ray,需要环境中安装 ray

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递任何参数)

作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于 backend:parallel 的值

  • “None”:无附加参数,忽略 backend_params

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的 joblib 后端,此处可传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobs,但 backend 除外,它由 backend 直接控制。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。此处可传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobs,在这种情况下 backend 必须作为 backend_params 的一个键传递。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “dask”:可传递 dask.compute 的任何有效键,例如 scheduler

  • “ray”:可传递以下键

    • “ray_remote_args”:ray.init 的有效键字典

    • “shutdown_ray”:bool 类型,默认值为 True;False 可阻止 ray 在并行化后

      关闭。

    • “logger_name”:str 类型,默认值为“ray”;要使用的日志记录器名称。

    • “mute_warnings”:bool 类型,默认值为 False;如果为 True,则抑制警告

返回:
self对自身的引用。

注意

改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic

set_params(**params)[source]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串 <component>__<parameter> 来访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果引用明确,例如,没有两个组件的参数名称相同 <parameter>,也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**paramsdict

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。如果 `get_params` 键中唯一,`__` 后缀可以作为完整字符串的别名。

返回:
self对自身的引用(设置参数后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 self.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为从 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 self 中的 random_state 参数,且仅当 deep=True 时应用于剩余组件对象。

注意:即使 self 没有 random_state 参数,或者任何组件都没有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 对象,即使是那些没有 random_state 参数的对象。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认值为 None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递 int 可在多次函数调用中获得可复现的输出。

deep布尔值,默认值=True

是否在具有 skbase 对象值的参数(即组件估计器)中设置随机状态。

  • 如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。

  • 如果为 True,则也会在组件对象中设置 random_state 参数。

self_policystr, 以下之一:{“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为“copy”
  • “copy”:self.random_state 被设置为输入的 random_state

  • “keep”:self.random_state 保持原样

  • “new”:self.random_state 被设置为一个新的随机状态,

从输入的 random_state 派生,通常与它不同

返回:
self对自身的引用
set_tags(**tag_dict)[source]#

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

每个 scikit-base 兼容对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。

set_tags 将动态标签覆盖设置为 tag_dict 中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要将标签设置到的值。

应仅在对象的 __init__ 方法中调用 set_tags 方法,即在构造期间,或通过 __init__ 构造后直接调用。

当前标签值可以通过 get_tagsget_tag 进行检查。

参数:
**tag_dictdict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
Self

对自身的引用。

transform(X, X2=None)[source]#

计算距离/核矩阵。

行为:返回成对距离/核矩阵

在 X 和 X2 中的样本之间(如果未传递 X2,则 X2 等于 X)

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
要转换的数据,其 Python 类型如下:

Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或

嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

sktime mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 m 个实例

可选,默认值:X = X2

要转换的数据,其 Python 类型如下:

Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或

嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

sktime mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X 和 X2 不必具有相同的 mtype

返回:
distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array

(i,j)-th 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核

transform_diag(X)[source]#

计算距离/核矩阵的对角线。

行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
要转换的数据,其 Python 类型如下:

Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或

嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

sktime mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

返回:
diag: 形状为 [n] 的 np.array

第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核