AggrDist#
- class AggrDist(transformer, aggfunc=None, aggfunc_is_symm=False)[source]#
来自表格距离聚合的面板距离。
- 通过对表格距离矩阵应用聚合函数获得的面板距离
示例:AggrDist(ScipyDist()) 是序列之间的平均欧几里得距离
形式化细节(对于实值对象,混合类型行同理):设 \(d: \mathbb{R}^k \times \mathbb{R}^{k}\rightarrow \mathbb{R}\) 是应用于
k
向量时,transformer
中的成对函数。设 \(f:\mathbb{R}^{n \ times m}\) 是应用于 \((n \times m)\) 矩阵时的函数aggfunc
。设 \(x_1, \dots, x_N\in \mathbb{R}^{n \times k}\), \(y_1, \dots y_M \in \mathbb{R}^{m \times k}\) 是矩阵集合,表示时间序列面板值输入X
和X2
,如下所示:\(x_i\) 是X
中的第i
个实例,\(x_{i, j\ell}\) 是X
的第j
个时间点、第\ell
个变量。对于 \(y\) 和X2
同理。然后,
transform(X, X2)
返回一个 \((N \times M)\) 矩阵,其第 \((i, j)\) 个条目为 \(f \left((d(x_{i, a}, y_{j, b}))_{a, b}\right)\),其中 \(x_{i, a}\) 表示 \(x_i\) 的第 \(a\) 行,\(y_{j, b}\) 表示 \(x_j\) 的第 \(b\) 行。- 参数:
- transformer: BasePairwiseTransformer scitype 的成对转换器
- aggfunc: 聚合函数 (2D np.array) -> float 或 None,可选
默认值 = None = np.mean
- aggfunc_is_symm: 布尔值,可选,默认值=False
- 聚合函数是否对称(应根据 aggfunc 设置)
- 即,参数转置后不变,始终满足
aggfunc(matrix) = aggfunc(np.transpose(matrix))
用于快速计算结果矩阵(如果对称)如果未知,False 是确保正确性的“安全”选项
- 属性:
is_fitted
是否已调用
fit
。
示例
时间序列之间的平均成对欧几里得距离
>>> from sktime.dists_kernels import AggrDist, ScipyDist >>> mean_euc_tsdist = AggrDist(ScipyDist())
时间序列之间的平均成对高斯核
>>> from sklearn.gaussian_process.kernels import RBF >>> mean_gaussian_tskernel = AggrDist(RBF())
方法
__call__
(X[, X2])计算距离/核矩阵,调用简写。
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
clone
()获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例列表及其名称列表。
fit
([X, X2])用于接口兼容性的 fit 方法(内部无逻辑)。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,具有来自父类的标签级别继承。
从类中获取类标签,具有来自父类的标签级别继承。
获取 self 的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取已拟合的参数。
获取对象的默认参数。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
get_tags
()从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])AggrDist 的测试参数。
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
reset
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的 self 保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级别标签覆盖设置为给定值。
transform
(X[, X2])计算距离/核矩阵。
计算距离/核矩阵的对角线。
- check_is_fitted(method_name=None)[source]#
检查估计器是否已拟合。
检查
_is_fitted
属性是否存在且为True
。is_fitted
属性应在调用对象的fit
方法时设置为True
。如果不是,则引发
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr,可选
调用此方法的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 引发:
- NotFittedError
如果估计器尚未拟合。
- clone()[source]#
获取具有相同超参数和配置的对象克隆。
克隆是另一个不共享引用、处于初始化后状态的对象。此函数等同于返回
sklearn.clone
的self
。等同于使用
self
的参数构造type(self)
的新实例,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。在值上也等同于调用
self.reset
,不同之处在于clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样改变self
。- 引发:
- 如果克隆不符合规范,由于
__init__
错误,则引发 RuntimeError。
- 如果克隆不符合规范,由于
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[source]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法应仅在对象的__init__
方法中调用,在构造期间或通过__init__
直接在构造后调用。动态标签被设置为
estimator
中标签的值,其名称在tag_names
中指定。tag_names
的默认值是将estimator
中的所有标签写入self
。当前标签值可以通过
get_tags
或get_tag
进行检查。- 参数:
- estimator:class:BaseObject 或派生类的实例
- tag_namesstr 或 str 列表,默认值 = None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回:
- self
self
的引用。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[source]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- parameter_setstr,默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,则将返回 “default” 集。
- 返回:
- instance具有默认参数的类实例
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[source]#
创建所有测试实例列表及其名称列表。
- 参数:
- parameter_setstr,默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果未为某个值定义特殊参数,则将返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是
cls(**cls.get_test_params()[i])
- namesstr 列表,长度与 objs 相同
第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称。如果实例不止一个,命名约定为
{cls.__name__}-{i}
,否则为{cls.__name__}
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[source]#
从类中获取类标签值,具有来自父类的标签级别继承。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。get_class_tag
方法是一个类方法,检索标签值时仅考虑类级别标签值和覆盖。它从对象中返回名称为
tag_name
的标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要检索可能包含实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。- 参数:
- tag_namestr
标签值的名称。
- tag_value_default任意类型
如果未找到标签,则为默认/回退值。
- 返回:
- tag_value
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,则返回tag_value_default
。
- classmethod get_class_tags()[source]#
从类中获取类标签,具有来自父类的标签级别继承。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。get_class_tags
方法是一个类方法,检索标签值时仅考虑类级别标签值和覆盖。它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的
_tags
的任何属性的键。值是对应的标签值,覆盖优先级降序如下
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索可能包含实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要包含来自动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不会被通过set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[source]#
获取 self 的配置标志。
配置是
self
的键值对,通常用作控制行为的瞬时标志。get_config
返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。默认配置在类或其父类的类属性
_config
中设置,并被通过set_config
设置的动态配置覆盖。在
clone
或reset
调用下保留配置。- 返回:
- config_dictdict
配置名 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后从 _onfig_dynamic 对象属性收集任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[source]#
获取已拟合的参数。
- 所需状态
要求状态为“拟合”。
- 参数:
- deep布尔值,默认值=True
是否返回组件的已拟合参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名 : 值字典,包括可拟合组件(= BaseEstimator 值参数)的已拟合参数。
如果为 False,将返回此对象的参数名 : 值字典,但不包括组件的已拟合参数。
- 返回:
- fitted_params键为 str 的 dict
已拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括
始终:此对象的所有已拟合参数,如通过
get_param_names
获取,值是此对象该键的已拟合参数值如果
deep=True
,还包含组件参数的键值对,组件参数的索引格式为[componentname]__[paramname]
,componentname
的所有参数都以paramname
及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- classmethod get_param_defaults()[source]#
获取对象的默认参数。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
在__init__
中定义了默认值的所有参数。值是默认值,如在__init__
中定义的。
- classmethod get_param_names(sort=True)[source]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- sort布尔值,默认值=True
是按字母顺序(True)还是按它们在类
__init__
中出现的顺序(False)返回参数名称。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,顺序与它们在类__init__
中出现的顺序相同。如果sort=True
,按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[source]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- deep布尔值,默认值=True
是否返回组件的参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名 : 值dict
,包括组件(=BaseObject
值参数)的参数。如果为
False
,将返回此对象的参数名 : 值dict
,但不包括组件的参数。
- 返回:
- params键为 str 的 dict
参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括
始终:此对象的所有参数,如通过
get_param_names
获取,值是此对象该键的参数值,值始终与构造时传递的值相同如果
deep=True
,还包含组件参数的键值对,组件参数的索引格式为[componentname]__[paramname]
,componentname
的所有参数都以paramname
及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[source]#
从实例中获取标签值,具有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签值,考虑标签覆盖,优先级降序如下通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- tag_namestr
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型,可选;默认值=None
如果未找到标签,则为默认/回退值
- raise_error布尔值
未找到标签时是否引发
ValueError
- 返回:
- tag_value任意
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,当raise_error
为 True 时引发错误,否则返回tag_value_default
。
- 引发:
- ValueError,如果
raise_error
为True
。 如果
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中,则引发ValueError
。
- ValueError,如果
- get_tags()[source]#
从实例中获取标签,具有标签级别继承和覆盖。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典。标签可用于存储关于对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
的任何属性的键,或通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是对应的标签值,覆盖优先级降序如下
通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后从_tags_dynamic
对象属性收集任何覆盖和新标签。
- is_composite()[source]#
检查对象是否由其他 BaseObject 组成。
复合对象是包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: 布尔值
对象是否有任何参数,其值是
BaseObject
后代实例。
- property is_fitted[source]#
是否已调用
fit
。检查对象的
_is_fitted` 属性,该属性应在对象构造期间初始化为 ``False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回:
- 布尔值
估计器是否已 fit。
- classmethod load_from_path(serial)[source]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- serialresult of ZipFile(path).open(“object)
- 返回:
- 反序列化的 self,结果输出到
path
,来自cls.save(path)
- 反序列化的 self,结果输出到
- classmethod load_from_serial(serial)[source]#
从序列化内存容器加载对象。
- 参数:
- serial
cls.save(None)
输出的第 1 个元素
- serial
- 返回:
- 反序列化的 self,结果输出
serial
,来自cls.save(None)
- 反序列化的 self,结果输出
- reset()[source]#
将对象重置为干净的初始化后状态。
结果是将
self
设置为构造函数调用后立即拥有的状态,具有相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也会被保留。一个
reset
调用会删除任何对象属性,除了超参数 = 写入
self
的__init__
的参数,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的一个参数包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性会被保留。
配置属性,配置会保留不变。即,
reset
前后get_config
的结果相等。
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
等同于
clone
,不同之处在于reset
改变self
而不是返回一个新对象。调用
self.reset()
后,self
在值和状态上与构造函数调用 ``type(self)(**self.get_params(deep=False))`` 后获得的对象相等。- 返回:
- self
类实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[source]#
将序列化的 self 保存到字节类对象或 (.zip) 文件。
行为:如果
path
为 None,返回内存中的序列化 self;如果path
是文件位置,则在该位置将 self 保存为 zip 文件保存的文件是 zip 文件,包含以下内容:_metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方式 (pickle)。
- 参数:
- pathNone 或文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,self 保存到内存对象;如果是文件位置,self 保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则将在当前工作目录创建 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则 zip 文件
estimator.zip
将被
存储在
/home/stored/
中。- serialization_format: str,默认值 = “pickle”
用于序列化的模块。可用选项包括“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中的序列化 self - 如果
path
是文件位置 - ZipFile,引用该文件
- 如果
- set_config(**config_dict)[source]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名 : 配置值对的字典。有效配置、值及其含义如下所示
- displaystr,“diagram”(默认值),或“text”
jupyter kernel 如何显示 self 的实例
“diagram” = html 框图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_only布尔值,默认值=True
打印 self 时是仅列出与默认值不同的 self 参数(False),还是列出所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响 self 而不影响组件估计器。
- warningsstr,“on”(默认值),或“off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 将不引发来自 sktime 的警告
- backend:parallelstr,可选,默认值=”None”
用于广播/向量化时的并行化后端,以下之一:
“None”:顺序执行循环,简单的列表推导式
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”:使用
dask
,需要环境中安装dask
包“ray”:使用
ray
,需要环境中安装ray
包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递任何参数)
作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值“None”:无附加参数,忽略
backend_params
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的
joblib
后端,此处可传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,但backend
除外,它由backend
直接控制。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。此处可传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,在这种情况下backend
必须作为backend_params
的一个键传递。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“dask”:可传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”:可传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”:bool 类型,默认值为 True;False 可阻止
ray
在并行化后 关闭。
- “shutdown_ray”:bool 类型,默认值为 True;False 可阻止
“logger_name”:str 类型,默认值为“ray”;要使用的日志记录器名称。
“mute_warnings”:bool 类型,默认值为 False;如果为 True,则抑制警告
- 返回:
- self对自身的引用。
注意
改变对象状态,将
config_dict
中的配置复制到self._config_dynamic
。
- set_params(**params)[source]#
设置此对象的参数。
该方法适用于简单的
skbase
对象以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串<component>__<parameter>
来访问组件<component>
中的<parameter>
。如果引用明确,例如,没有两个组件的参数名称相同<parameter>
,也可以使用不带<component>__
的字符串<parameter>
。- 参数:
- **paramsdict
BaseObject 参数,键必须是
<component>__<parameter>
字符串。如果 `get_params` 键中唯一,`__` 后缀可以作为完整字符串的别名。
- 返回:
- self对自身的引用(设置参数后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[source]#
为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
self.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。根据
self_policy
应用于self
中的random_state
参数,且仅当deep=True
时应用于剩余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者任何组件都没有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是那些没有random_state
参数的对象。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认值为 None
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递 int 可在多次函数调用中获得可复现的输出。
- deep布尔值,默认值=True
是否在具有
skbase
对象值的参数(即组件估计器)中设置随机状态。如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则也会在组件对象中设置
random_state
参数。
- self_policystr, 以下之一:{“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为“copy”
“copy”:
self.random_state
被设置为输入的random_state
“keep”:
self.random_state
保持原样“new”:
self.random_state
被设置为一个新的随机状态,
从输入的
random_state
派生,通常与它不同
- 返回:
- self对自身的引用
- set_tags(**tag_dict)[source]#
将实例级别标签覆盖设置为给定值。
每个
scikit-base
兼容对象都有一个标签字典,用于存储关于对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会改变的静态标志。它们可用于元数据检查或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要将标签设置到的值。应仅在对象的
__init__
方法中调用set_tags
方法,即在构造期间,或通过__init__
构造后直接调用。当前标签值可以通过
get_tags
或get_tag
进行检查。- 参数:
- **tag_dictdict
标签名称:标签值对的字典。
- 返回:
- Self
对自身的引用。
- transform(X, X2=None)[source]#
计算距离/核矩阵。
- 行为:返回成对距离/核矩阵
在 X 和 X2 中的样本之间(如果未传递 X2,则 X2 等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,其 Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或
嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 受
sktime
mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 受
- X2Series 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 m 个实例
可选,默认值:X = X2
- 要转换的数据,其 Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或
嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 受
sktime
mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 受
X 和 X2 不必具有相同的 mtype
- 返回:
- distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array
(i,j)-th 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[source]#
计算距离/核矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,包含 n 个实例
- 要转换的数据,其 Python 类型如下:
Series: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) Panel: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表, 或
嵌套 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 受
sktime
mtype 格式规范约束,更多详细信息请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 受
- 返回:
- diag: 形状为 [n] 的 np.array
第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核