HMM#
- 类 HMM(emission_funcs: list, transition_prob_mat: ndarray, initial_probs: ndarray = None)[source]#
实现了一个使用维特比算法拟合的简单隐马尔可夫模型(HMM)。
HMM 注释估计器使用维特比算法将一系列“隐状态”类别注释(表示为一个与观测序列大小相同的整数数组)拟合到观测序列上。
这是通过找到给定发射概率(即特定观测值由给定隐状态产生的概率)、转移概率(即从一个状态转移到另一个状态或保持在同一状态的概率)以及初始概率(即对观测序列开始时隐状态概率分布的信念)的最可能路径来完成的。
- 当前实现的假设/限制
假设时间序列点之间的间隔是等价的。
它只适用于单变量数据。
- 发射参数和转移概率是
假设已知。
- 如果未传递初始概率,则会分配均匀概率
(即而不是平稳分布)。
需要并返回 np.ndarrays。
_fit 当前为空,因为需要将概率分布的参数传递给算法。
_predict - 首先计算 transition_probability 和 transition_id 矩阵 - 这两个都是 nxm 矩阵,其中 n 是隐状态的数量,m 是观测值的数量。转移概率矩阵记录将观测值
m
分配给隐状态 n 的最可能序列的概率。transition_id 矩阵记录在最可能路径中先于隐状态 n 的前一步。这个逻辑主要由辅助函数 _calculate_trans_mats 完成。接下来,这些矩阵用于计算最可能的路径(通过从最终最可能的状态及其前面的 id 回溯)。这个逻辑通过辅助函数 hmm_viterbi_label 完成。- 参数:
- emission_funcslist, 形状 = [隐状态数量]
列表长度应为 n(隐状态的数量)。可以是可调用对象列表 [fx_1, fx_2],其签名为 fx_1(X) -> float,或可调用对象及其匹配的关键字参数列表 [(fx_1, kwarg_1), (fx_2, kwarg_2)],其签名为 fx_1(X, **kwargs) -> float(或两者混合的列表)。这些可调用对象应接受一个值并在传递单个观测值时返回一个概率。所有函数都应是在与观测数据相同空间上正确归一化的 PDF。
- transition_prob_mat: 2D np.ndarry, 形状 = [num_states, num_states]
每行之和应为 1,以便正确归一化(即第 i 行中的第 j 列代表从状态 i 转移到状态 j 的概率)。
- initial_probs: 1D np.ndarray, 形状 = [隐状态数量], 可选
一个表示隐状态序列开始于每个隐状态的概率数组。如果传递,其长度应为隐状态的数量
n
,并且应与 emission funcs 列表和 transition_prob_mat 的长度匹配。初始概率应反映先验信念。如果未传递,每个隐状态将分配相同的初始概率。
- 属性:
- emission_funcslist, 形状 = [隐状态数量]
用于计算发射概率的函数。取自同名的 __init__ 参数。
- transition_prob_mat: 2D np.ndarry, 形状 = [num_states, num_states]
从隐状态到隐状态的转移概率矩阵。取自同名的 __init__ 参数。
- initial_probs1D np.ndarray, 形状 = [隐状态数量]
关于第一个状态的隐状态身份的概率。如果传递了同名的 __init__ 参数,它将取该值。否则,它被设置为在所有隐状态上均匀分布。
- num_statesint
隐状态的数量。设置为传递的 emission_funcs 参数的长度。
- stateslist
一个包含从 0 到 num_states-1 的整数列表。用于隐状态的整数标签。
- num_obsint
观测数据的长度。从数据中提取。
- trans_prob2D np.ndarray, 形状 = [观测数量, 隐状态数量]
形状 [观测数量, 隐状态数量]。该观测值被分配给该隐状态的最大概率。在 _calculate_trans_mat 中计算并在 _predict 中赋值。
- trans_id2D np.ndarray, 形状 = [观测数量, 隐状态数量]
形状 [观测数量, 隐状态数量]。在最可能路径中,先于该观测值被分配给该隐状态的状态 ID。在 _calculate_trans_mat 中计算并在 _predict 中赋值。
示例
>>> from sktime.detection.hmm import HMM >>> from scipy.stats import norm >>> from numpy import asarray >>> # define the emission probs for our HMM model: >>> centers = [3.5,-5] >>> sd = [.25 for i in centers] >>> emi_funcs = [(norm.pdf, {'loc': mean, ... 'scale': sd[ind]}) for ind, mean in enumerate(centers)] >>> hmm_est = HMM(emi_funcs, asarray([[0.25,0.75], [0.666, 0.333]])) >>> # generate synthetic data (or of course use your own!) >>> obs = asarray([3.7,3.2,3.4,3.6,-5.1,-5.2,-4.9]) >>> hmm_est = hmm_est.fit(obs) >>> labels = hmm_est.predict(obs)
方法
change_points_to_segments
(y_sparse[, start, end])将一系列变化点索引转换为段。
check_is_fitted
([method_name])检查估计器是否已拟合。
克隆
()获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])使用第一个测试参数集构造类的实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表及其名称列表。
dense_to_sparse
(y_dense)将检测器的密集输出转换为稀疏格式。
fit
(X[, y])拟合训练数据。
fit_predict
(X[, y])拟合数据,然后进行预测。
fit_transform
(X[, y])拟合数据,然后进行变换。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])从类中获取类标签值,并继承父类的标签级别。
从类中获取类标签,并继承父类的标签级别。
获取自身的配置标志。
get_fitted_params
([deep])获取拟合参数。
获取对象的默认参数。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从实例中获取标签值,并继承标签级别和覆盖。
get_tags
()从实例中获取标签,并继承标签级别和覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化内存容器加载对象。
predict
(X)在测试/部署数据上创建标签。
在测试/部署数据上预测变化点/异常点。
返回测试/部署数据上预测标签的分数。
在测试/部署数据上预测段。
reset
()将对象重置为干净的初始化后状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的自身保存到类似字节的对象或 (.zip) 文件。
segments_to_change_points
(y_sparse)将段转换为变化点。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将实例级别标签覆盖设置为给定值。
sparse_to_dense
(y_sparse, index)将检测器的稀疏输出转换为密集格式。
transform
(X)在测试/部署数据上创建标签。
返回测试/部署数据上预测标签的分数。
update
(X[, y])使用新数据和可选的真实标签更新模型。
update_predict
(X[, y])使用新数据更新模型并为其创建标签。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回
"default"
集。
- 返回值:
- paramsdict 或 dict 列表
- static change_points_to_segments(y_sparse, start=None, end=None)[源代码]#
将一系列变化点索引转换为段。
- 参数:
- y_sparsepd.Series,整数类型,升序排序
一个包含变化点iloc索引的序列。
- start可选,默认为0
第一个段的起始点。必须在第一个变化点之前,即 < y_sparse[0]。
- end可选,默认为 y_sparse[-1] + 1
最后一个段的结束点。必须在最后一个变化点之后,即 > y_sparse[-1]。
- 返回值:
- pd.Series
一个带有区间索引的序列,表示段的起始点和结束点。序列的值是段的标签。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.detection.base import BaseDetector >>> change_points = pd.Series([1, 2, 5]) >>> BaseDetector.change_points_to_segments(change_points, 0, 7) [0, 1) 0 [1, 2) 1 [2, 5) 2 [5, 7) 3 dtype: int64
- check_is_fitted(method_name=None)[源代码]#
检查估计器是否已拟合。
检查属性
_is_fitted
是否存在且为True
。在调用对象的fit
方法时,应将属性is_fitted
设置为True
。如果不是,则抛出
NotFittedError
。- 参数:
- method_namestr,可选
调用此方法的函数的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。
- 抛出:
- 未拟合错误
如果估计器尚未拟合。
- clone()[源代码]#
获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。
克隆是一个不同的对象,没有共享引用,处于初始化后状态。此函数等同于返回
self
的sklearn.clone
。等同于构造一个
type(self)
的新实例,使用self
的参数,即type(self)(**self.get_params(deep=False))
。如果在
self
上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用cloned_self.set_config(**self.get_config())
。在功能上也等同于调用
self.reset
,不同之处在于clone
返回一个新对象,而不是像reset
那样改变self
。- 抛出:
- 如果克隆不符合规范(由于
__init__
错误),则抛出 RuntimeError。
- 如果克隆不符合规范(由于
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#
从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。clone_tags
从另一个对象estimator
设置动态标签覆盖。clone_tags
方法只能在对象的__init__
方法中调用,即在构造过程中或通过__init__
直接构造之后调用。动态标签的值设置为
estimator
中标签的值,名称由tag_names
指定。tag_names
的默认值是将estimator
中的所有标签写入self
。当前的标签值可以通过
get_tags
或get_tag
查看。- 参数:
- estimator:class:BaseObject 或其派生类的实例
- tag_namesstr 或 list of str,默认为 None
要克隆的标签名称。默认值 (
None
) 克隆estimator
中的所有标签。
- 返回值:
- self
对
self
的引用。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#
使用第一个测试参数集构造类的实例。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回“default”集合。
- 返回值:
- instance使用默认参数的类实例
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#
创建所有测试实例的列表及其名称列表。
- 参数:
- parameter_setstr, 默认=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回“default”集合。
- 返回值:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是
cls(**cls.get_test_params()[i])
- namesstr 列表,与 objs 长度相同
第 i 个元素是测试中 objs 的第 i 个实例的名称。命名约定是如果实例多于一个则为
{cls.__name__}-{i}
,否则为{cls.__name__}
。
- static dense_to_sparse(y_dense)[源代码]#
将检测器的密集输出转换为稀疏格式。
- 参数:
- y_densepd.Series
如果
y_dense
只包含 1 和 0,则 1 表示变化点或异常。如果
y_dense
只包含大于 0 的整数,则它是一个段数组。
- 返回值:
- pd.Series
如果
y_dense
是变化点/异常的密集序列,则返回一个包含变化点/异常索引的 pandas 稀疏序列。如果
y_dense
是段的密集序列,则返回一个带有区间数据类型索引的稀疏序列。序列的值将是段的标签。
- fit(X, y=None)[源代码]#
拟合训练数据。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
用于拟合模型(时间序列)的训练数据。
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。
用于训练的已知事件,在
X
中,如果检测器是监督式的。y
的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。
- 返回值:
- self
对 self 的引用。
注意
创建拟合模型,更新以“_”结尾的属性。将 _is_fitted 标志设置为 True。
- fit_predict(X, y=None)[源代码]#
拟合数据,然后进行预测。
使用给定的检测参数对 X 和 Y 进行模型拟合,并返回模型产生的检测标签。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
待转换数据
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。
用于训练的已知事件,在
X
中,如果检测器是监督式的。y
的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。
- 返回值:
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame
检测到或预测的事件。
y
的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。
- fit_transform(X, y=None)[源代码]#
拟合数据,然后进行变换。
使用给定的检测参数对 X 和 Y 进行模型拟合,并返回模型产生的检测标签。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
待转换数据
- ypd.Series 或 np.ndarray,可选 (默认为 None)
待预测数据的目标值。
- 返回值:
- y与 X 索引相同的 pd.DataFrame
序列
X
的标签。如果
task
是"anomaly_detection"
,值是整数标签。值为 0 表示X
在同一时间索引处没有异常。其他值表示异常。大多数检测器将返回 0 或 1,但有些检测器如果能检测到不同类型的异常,可能会返回更多值。指示X
在同一索引处是否为异常,0 表示否,1 表示是。如果
task
是"changepoint_detection"
,值是整数标签,指示变化点之间的段的标签。可能的标签是从 0 开始的整数。如果
task
是“segmentation”,值是段的整数标签。可能的标签是从 0 开始的整数。
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#
从类中获取类标签值,并继承父类的标签级别。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。get_class_tag
方法是一个类方法,只考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它从对象中返回名称为
tag_name
的标签值,按以下优先级降序考虑标签覆盖在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。要检索可能带有实例覆盖的标签值,请改用
get_tag
方法。- 参数:
- tag_namestr
标签值的名称。
- tag_value_default任意类型
如果未找到标签,则使用的默认/回退值。
- 返回值:
- tag_value
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,则返回tag_value_default
。
- classmethod get_class_tags()[源代码]#
从类中获取类标签,并继承父类的标签级别。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_class_tags
方法是一个类方法,只考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的
_tags
属性的任何键。值是相应的标签值,覆盖顺序按以下优先级降序排列
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
实例可以根据超参数覆盖这些标签。
要检索可能带有实例覆盖的标签,请改用
get_tags
方法。不考虑通过
set_tags
或clone_tags
在实例上设置的动态标签覆盖。对于包含动态标签的覆盖,请使用
get_tags
。- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集。不会被set_tags
或clone_tags
设置的动态标签覆盖。
- get_config()[源代码]#
获取自身的配置标志。
配置是
self
的键值对,通常用作控制行为的临时标志。get_config
返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。默认配置设置在类或其父类的
_config
类属性中,并被通过set_config
设置的动态配置覆盖。在调用
clone
或reset
时会保留配置。- 返回值:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[源代码]#
获取拟合参数。
- 所需状态
要求状态为“已拟合”。
- 参数:
- deepbool,默认为 True
是否返回组件的拟合参数。
如果为 True,则返回此对象的参数名称 : 值字典,包括可拟合组件的拟合参数(= BaseEstimator 类型参数)。
如果为 False,则返回此对象的参数名称 : 值字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回值:
- fitted_params带有 str 值键的 dict
拟合参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括
始终:此对象的所有拟合参数,如通过
get_param_names
所示,值是此对象该键的拟合参数值如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为[componentname]__[paramname]
componentname
的所有参数以paramname
形式及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- classmethod get_param_defaults()[源代码]#
获取对象的默认参数。
- 返回值:
- default_dict: dict[str, Any]
键是
cls
在__init__
中定义了默认值的所有参数。值是在__init__
中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- sortbool,默认为 True
是否按字母顺序排序返回参数名称 (True),还是按它们在类
__init__
中出现的顺序返回 (False)。
- 返回值:
- param_names: list[str]
cls
的参数名称列表。如果sort=False
,则按它们在类__init__
中出现的相同顺序返回。如果sort=True
,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[源代码]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- deepbool,默认为 True
是否返回组件的参数。
如果为
True
,将返回此对象的参数名称 : 值dict
,包括组件的参数(=BaseObject
类型参数)。如果为
False
,将返回此对象的参数名称 : 值dict
,但不包括组件的参数。
- 返回值:
- params带有 str 值键的 dict
参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括
始终:此对象的所有参数,如通过
get_param_names
所示,值是此对象该键的参数值,值始终与构造时传递的值相同如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为[componentname]__[paramname]
componentname
的所有参数以paramname
形式及其值出现如果
deep=True
,还包含任意级别的组件递归,例如[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#
从实例中获取标签值,并继承标签级别和覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tag
方法从实例中检索名称为tag_name
的单个标签值,按以下优先级降序考虑标签覆盖通过实例上的
set_tags
或clone_tags
设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 参数:
- tag_namestr
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型,可选;默认为 None
如果未找到标签,则使用的默认/回退值
- raise_errorbool
未找到标签时是否抛出
ValueError
- 返回值:
- tag_valueAny
self
中tag_name
标签的值。如果未找到,则在raise_error
为 True 时抛出错误,否则返回tag_value_default
。
- 抛出:
- ValueError,如果
raise_error
为True
。 如果
tag_name
不在self.get_tags().keys()
中,则抛出ValueError
。
- ValueError,如果
- get_tags()[源代码]#
从实例中获取标签,并继承标签级别和覆盖。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。get_tags
方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的_tags
属性的任何键,或通过set_tags
或clone_tags
设置的标签。值是相应的标签值,覆盖顺序按以下优先级降序排列
通过实例上的
set_tags
或clone_tags
设置的标签,
在实例构造时。
在类的
_tags
属性中设置的标签。在父类的
_tags
属性中设置的标签,
按继承顺序。
- 返回值:
- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从
_tags
类属性收集,然后是来自_tags_dynamic
对象属性的任何覆盖和新标签。
- is_composite()[源代码]#
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回值:
- composite: bool
对象是否包含任何参数,其值是
BaseObject
的后代实例。
- property is_fitted[源代码]#
是否已调用
fit
。检查对象的
_is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为
``False
,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。- 返回值:
- bool
估计器是否已 拟合。
- classmethod load_from_path(serial)[源代码]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- serialZipFile(path).open(“object) 的结果
- 返回值:
- 反序列化的 self,生成
cls.save(path)
在path
处的输出
- 反序列化的 self,生成
- classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#
从序列化内存容器加载对象。
- 参数:
- serial
cls.save(None)
输出的第一个元素
- serial
- 返回值:
- 反序列化的 self,生成
cls.save(None)
的输出serial
- 反序列化的 self,生成
- predict(X)[源代码]#
在测试/部署数据上创建标签。
此方法返回特定于检测任务的类似列表的类型,例如,分段任务返回段,异常检测任务返回异常。
编码因任务和 learning_type(标签)而异,详见下文。
对于跨任务类型一致的返回值,请参阅
predict_points
和predict_segments
。- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
进行检测的时间序列,将分配标签或分数。
- 返回值:
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame
检测到或预测的事件。
y
的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。
- predict_points(X)[源代码]#
在测试/部署数据上预测变化点/异常点。
与
predict
的主要区别在于,即使任务不是异常或变化点检测,此方法也始终返回一个包含关注点的pd.DataFrame
。- 参数:
- Xpd.DataFrame
进行检测的时间序列,将分配标签或分数。
- 返回值:
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame
包含以下列的
pd.DataFrame
"ilocs"
- 始终存在。值为整数,是iloc
引用X
索引,表示关注点。"labels"
- 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或异常聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中段的含义如下如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则值是变化点/异常的整数索引。如果
task
是"segmentation"
,则值是连续的段边界。
"labels"
是关注点的潜在标签。
- predict_scores(X)[源代码]#
返回测试/部署数据上预测标签的分数。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
待标注数据(时间序列)。
- 返回值:
- scores与 predict 返回值具有相同索引的 pd.DataFrame
序列
X
的预测分数。
- predict_segments(X)[源代码]#
在测试/部署数据上预测段。
与
predict
的主要区别在于,即使任务不是分段,此方法也始终返回一个包含关注段的pd.DataFrame
。- 参数:
- Xpd.DataFrame
进行检测的时间序列,将分配标签或分数。
- 返回值:
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame
包含以下列的
pd.DataFrame
"ilocs"
- 始终存在。值为左闭区间,左/右值是iloc
引用X
索引,表示段。"labels"
- 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中段的含义如下如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则这些区间是变化点/异常之间的区间,潜在标签是从 0 开始的连续整数。如果
task
是"segmentation"
,则值是分段标签。
- reset()[源代码]#
将对象重置为干净的初始化后状态。
将
self
设置为构造函数调用后立即具有的状态,使用相同的超参数。通过set_config
设置的配置值也会保留。调用
reset
会删除任何对象属性,除了超参数 = 写入
self
的__init__
参数,例如self.paramname
,其中paramname
是__init__
的参数包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性会保留。
配置属性,配置保持不变。也就是说,在
reset
前后调用get_config
的结果是相等的。
类方法和对象方法,以及类属性也都不受影响。
等同于
clone
,不同之处在于reset
改变self
,而不是返回一个新对象。调用
self.reset()
后,self
的值和状态与构造函数调用type(self)(**self.get_params(deep=False))
后获得的对象相等。- 返回值:
- self
类实例重置到干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
- save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#
将序列化的自身保存到类似字节的对象或 (.zip) 文件。
行为:如果
path
为 None,则返回内存中的序列化 self;如果path
是文件位置,则将 self 以 zip 文件形式存储在该位置保存的文件是 zip 文件,内容如下: _metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方法 (pickle)。
- 参数:
- pathNone 或文件位置 (str 或 Path)
如果为 None,则将 self 保存到内存对象;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果
path=”estimator”,则将在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件
estimator.zip
。path=”/home/stored/estimator”,则将在
/home/stored/
中创建一个 zip 文件estimator.zip
。
存储在
/home/stored/
中。- serialization_format: str,默认为 “pickle”
用于序列化的模块。可用选项包括“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回值:
- 如果
path
为 None - 内存中的序列化 self - 如果
path
是文件位置 - 指向该文件的 ZipFile
- 如果
- static segments_to_change_points(y_sparse)[源代码]#
将段转换为变化点。
- 参数:
- y_sparsepd.DataFrame
一个段的序列。索引必须是区间数据类型,值应是段的整数标签。
- 返回值:
- pd.Index
一个包含每个段起始点索引的 Index 数组。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.detection.base import BaseDetector >>> segments = pd.DataFrame({ "ilocs": pd.IntervalIndex.from_tuples([(0, 3), (3, 4), (4, 5), (5, 6), (6, 7), (7, 8), (8, 10), (10, 11), (11, 12), (12, 20)]), "labels": [0, 2, 1, 0, 2, 1, 0, 2, 1, 0] }) >>> BaseDetector.segments_to_change_points(segments) Index([0, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12], dtype='int64')
- set_config(**config_dict)[源代码]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示
- displaystr,“diagram”(默认)或“text”
jupyter kernel 如何显示 self 的实例
“diagram” = HTML 框图表示
“text” = 字符串输出
- print_changed_onlybool,默认为 True
打印 self 时是否只列出与默认值不同的参数 (False),或列出所有参数名称和值 (False)。不嵌套,即只影响 self,不影响组件估计器。
- warningsstr,“on”(默认)或“off”
是否触发警告,只影响来自 sktime 的警告
“on” = 将触发来自 sktime 的警告
“off” = 不会触发来自 sktime 的警告
- backend:parallelstr,可选,默认为“None”
进行广播/向量化时用于并行化的后端,可以是以下之一
“None”:顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”:使用
dask
,需要在环境中安装dask
包“ray”:使用
ray
,需要在环境中安装ray
包
- backend:parallel:paramsdict,可选,默认为 {} (不传递参数)
作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于
backend:parallel
的值“None”:无附加参数,
backend_params
被忽略“loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的
joblib
后端。这里可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,但backend
除外,它直接由backend
控制。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。这里可以传递joblib.Parallel
的任何有效键,例如n_jobs
,在这种情况下,backend
必须作为backend_params
的键传递。如果未传递n_jobs
,则默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“dask”:可以传递
dask.compute
的任何有效键,例如scheduler
“ray”:可以传递以下键
“ray_remote_args”:
ray.init
的有效键字典- “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 阻止
ray
在并行化后 关闭。
- “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 阻止
“logger_name”:str,默认为“ray”;要使用的日志记录器名称。
“mute_warnings”:bool,默认为 False;如果为 True,则抑制警告
- 返回值:
- self对 self 的引用。
注意
改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[源代码]#
设置此对象的参数。
此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串
<component>__<parameter>
来访问组件<component>
中的<parameter>
。如果引用明确,例如没有两个组件参数同名<parameter>
,则也可以使用不带<component>__
的字符串<parameter>
。- 参数:
- **paramsdict
BaseObject 参数,键必须是
<component>__<parameter>
字符串。如果后缀__
在 get_params 键中唯一,则可以作为完整字符串的别名。
- 返回值:
- self对 self 的引用(设置参数后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#
为自身设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
self.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将它们设置为从random_state
导出的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。根据
self_policy
应用于self
中的random_state
参数,当且仅当deep=True
时,也应用于剩余组件对象。注意:即使
self
没有random_state
参数,或者任何组件都没有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
对象,即使是那些没有random_state
参数的对象。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None,默认为 None
用于控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递 int 以便在多次函数调用中获得可复现的输出。
- deepbool,默认为 True
是否在 skbase 对象值参数中设置随机状态,即组件估计器。
如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则也会在组件对象中设置
random_state
参数。
- self_policystr,以下之一 {“copy”, “keep”, “new”},默认为“copy”
“copy”:将
self.random_state
设置为输入的random_state
“keep”:
self.random_state
保持原样“new”:将
self.random_state
设置为新的随机状态,
从输入的
random_state
派生,并且通常与它不同
- 返回值:
- self对 self 的引用
- set_tags(**tag_dict)[源代码]#
将实例级别标签覆盖设置为给定值。
每个兼容
scikit-base
的对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。标签是特定于实例
self
的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查,或控制对象的行为。set_tags
将动态标签覆盖设置为tag_dict
中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要设置的标签值。set_tags
方法只能在对象的__init__
方法中调用,即在构造过程中或通过__init__
直接构造之后调用。当前的标签值可以通过
get_tags
或get_tag
查看。- 参数:
- **tag_dictdict
标签名称 : 标签值对的字典。
- 返回值:
- Self
对 self 的引用。
- static sparse_to_dense(y_sparse, index)[源代码]#
将检测器的稀疏输出转换为密集格式。
- 参数:
- y_sparsepd.Series
如果
y_sparse
是一个带有区间索引的序列,它应该表示段,其中序列的每个值都是段的标签。未分类的区间应标记为 -1。段的标签绝不能是 0。如果
y_sparse
的索引不是区间集,则序列的值应表示变化点/异常的索引。
- index类数组
包含
y_sparse
中事件索引的更大的索引集,用作返回序列的索引。
- 返回值:
- pd.Series
返回一个以
index
为索引的序列。* 如果y_sparse
是变化点/异常的序列,则返回的序列根据索引是否与异常/变化点相关联而标记为 0 和 1。其中 1 表示异常/变化点。
如果
y_sparse
是段的序列,则返回的序列根据其索引所属的段进行标记。不属于任何段的索引标记为 -1。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.detection.base import BaseDetector >>> y_sparse = pd.Series([2, 5, 7]) # Indices of changepoints/anomalies >>> index = range(0, 8) >>> BaseDetector.sparse_to_dense(y_sparse, index=index) 0 0 1 0 2 1 3 0 4 0 5 1 6 0 7 1 dtype: int64 >>> y_sparse = pd.Series( ... [1, 2, 1], ... index=pd.IntervalIndex.from_arrays( ... [0, 4, 6], [4, 6, 10], closed="left" ... ) ... ) >>> index = range(10) >>> BaseDetector.sparse_to_dense(y_sparse, index=index) 0 1 1 1 2 1 3 1 4 2 5 2 6 1 7 1 8 1 9 1 dtype: int64
- transform(X)[源代码]#
在测试/部署数据上创建标签。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
进行检测的时间序列,将分配标签或分数。
- 返回值:
- y与 X 索引相同的 pd.DataFrame
序列
X
的标签。如果
task
是"anomaly_detection"
,值是整数标签。值为 0 表示X
在同一时间索引处没有异常。其他值表示异常。大多数检测器将返回 0 或 1,但有些检测器如果能检测到不同类型的异常,可能会返回更多值。指示X
在同一索引处是否为异常,0 表示否,1 表示是。如果
task
是"changepoint_detection"
,值是整数标签,指示变化点之间的段的标签。可能的标签是从 0 开始的整数。如果
task
是“segmentation”,值是段的整数标签。可能的标签是从 0 开始的整数。
- transform_scores(X)[源代码]#
返回测试/部署数据上预测标签的分数。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
待标注数据(时间序列)。
- 返回值:
- scores与 X 索引相同的 pd.DataFrame
序列
X
的分数。
- update(X, y=None)[源代码]#
使用新数据和可选的真实标签更新模型。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
用于更新模型(时间序列)的训练数据。
- ypd.Series,可选
用于训练的真实标签,如果检测器是监督式的。
- 返回值:
- self
对 self 的引用。
注意
更新已拟合模型,更新以“_”结尾的属性。
- update_predict(X, y=None)[源代码]#
使用新数据更新模型并为其创建标签。
- 参数:
- Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray
用于更新模型的时间序列训练数据。
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。
用于训练的已知事件,在
X
中,如果检测器是监督式的。y
的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。
- 返回值:
- y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame
检测到或预测的事件。
y
的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列"ilocs"
- 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过iloc
引用X
的索引,或X
的索引范围,如下所示。"label"
- 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或段聚类。
"ilocs"
列和"labels"
列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示如果
task
是"anomaly_detection"
或"change_point_detection"
,则"ilocs"
包含事件发生的 iloc 索引。如果
task
是"segmentation"
,则"ilocs"
包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。
"labels"
列中的标签(如果存在)指示事件的类型。