HMM#

HMM(emission_funcs: list, transition_prob_mat: ndarray, initial_probs: ndarray = None)[source]#

实现了一个使用维特比算法拟合的简单隐马尔可夫模型(HMM)。

HMM 注释估计器使用维特比算法将一系列“隐状态”类别注释(表示为一个与观测序列大小相同的整数数组)拟合到观测序列上。

这是通过找到给定发射概率(即特定观测值由给定隐状态产生的概率)、转移概率(即从一个状态转移到另一个状态或保持在同一状态的概率)以及初始概率(即对观测序列开始时隐状态概率分布的信念)的最可能路径来完成的。

当前实现的假设/限制
  • 假设时间序列点之间的间隔是等价的。

  • 它只适用于单变量数据。

  • 发射参数和转移概率是

    假设已知。

  • 如果未传递初始概率,则会分配均匀概率

    (即而不是平稳分布)。

  • 需要并返回 np.ndarrays。

_fit 当前为空,因为需要将概率分布的参数传递给算法。

_predict - 首先计算 transition_probability 和 transition_id 矩阵 - 这两个都是 nxm 矩阵,其中 n 是隐状态的数量,m 是观测值的数量。转移概率矩阵记录将观测值 m 分配给隐状态 n 的最可能序列的概率。transition_id 矩阵记录在最可能路径中先于隐状态 n 的前一步。这个逻辑主要由辅助函数 _calculate_trans_mats 完成。接下来,这些矩阵用于计算最可能的路径(通过从最终最可能的状态及其前面的 id 回溯)。这个逻辑通过辅助函数 hmm_viterbi_label 完成。

参数:
emission_funcslist, 形状 = [隐状态数量]

列表长度应为 n(隐状态的数量)。可以是可调用对象列表 [fx_1, fx_2],其签名为 fx_1(X) -> float,或可调用对象及其匹配的关键字参数列表 [(fx_1, kwarg_1), (fx_2, kwarg_2)],其签名为 fx_1(X, **kwargs) -> float(或两者混合的列表)。这些可调用对象应接受一个值并在传递单个观测值时返回一个概率。所有函数都应是在与观测数据相同空间上正确归一化的 PDF。

transition_prob_mat: 2D np.ndarry, 形状 = [num_states, num_states]

每行之和应为 1,以便正确归一化(即第 i 行中的第 j 列代表从状态 i 转移到状态 j 的概率)。

initial_probs: 1D np.ndarray, 形状 = [隐状态数量], 可选

一个表示隐状态序列开始于每个隐状态的概率数组。如果传递,其长度应为隐状态的数量 n,并且应与 emission funcs 列表和 transition_prob_mat 的长度匹配。初始概率应反映先验信念。如果未传递,每个隐状态将分配相同的初始概率。

属性:
emission_funcslist, 形状 = [隐状态数量]

用于计算发射概率的函数。取自同名的 __init__ 参数。

transition_prob_mat: 2D np.ndarry, 形状 = [num_states, num_states]

从隐状态到隐状态的转移概率矩阵。取自同名的 __init__ 参数。

initial_probs1D np.ndarray, 形状 = [隐状态数量]

关于第一个状态的隐状态身份的概率。如果传递了同名的 __init__ 参数,它将取该值。否则,它被设置为在所有隐状态上均匀分布。

num_statesint

隐状态的数量。设置为传递的 emission_funcs 参数的长度。

stateslist

一个包含从 0 到 num_states-1 的整数列表。用于隐状态的整数标签。

num_obsint

观测数据的长度。从数据中提取。

trans_prob2D np.ndarray, 形状 = [观测数量, 隐状态数量]

形状 [观测数量, 隐状态数量]。该观测值被分配给该隐状态的最大概率。在 _calculate_trans_mat 中计算并在 _predict 中赋值。

trans_id2D np.ndarray, 形状 = [观测数量, 隐状态数量]

形状 [观测数量, 隐状态数量]。在最可能路径中,先于该观测值被分配给该隐状态的状态 ID。在 _calculate_trans_mat 中计算并在 _predict 中赋值。

示例

>>> from sktime.detection.hmm import HMM
>>> from scipy.stats import norm
>>> from numpy import asarray
>>> # define the emission probs for our HMM model:
>>> centers = [3.5,-5]
>>> sd = [.25 for i in centers]
>>> emi_funcs = [(norm.pdf, {'loc': mean,
...  'scale': sd[ind]}) for ind, mean in enumerate(centers)]
>>> hmm_est = HMM(emi_funcs, asarray([[0.25,0.75], [0.666, 0.333]]))
>>> # generate synthetic data (or of course use your own!)
>>> obs = asarray([3.7,3.2,3.4,3.6,-5.1,-5.2,-4.9])
>>> hmm_est = hmm_est.fit(obs)
>>> labels = hmm_est.predict(obs)

方法

change_points_to_segments(y_sparse[, start, end])

将一系列变化点索引转换为段。

check_is_fitted([method_name])

检查估计器是否已拟合。

克隆()

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

使用第一个测试参数集构造类的实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称列表。

dense_to_sparse(y_dense)

将检测器的密集输出转换为稀疏格式。

fit(X[, y])

拟合训练数据。

fit_predict(X[, y])

拟合数据,然后进行预测。

fit_transform(X[, y])

拟合数据,然后进行变换。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

从类中获取类标签值,并继承父类的标签级别。

get_class_tags()

从类中获取类标签,并继承父类的标签级别。

get_config()

获取自身的配置标志。

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的默认参数。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从实例中获取标签值,并继承标签级别和覆盖。

get_tags()

从实例中获取标签,并继承标签级别和覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化内存容器加载对象。

predict(X)

在测试/部署数据上创建标签。

predict_points(X)

在测试/部署数据上预测变化点/异常点。

predict_scores(X)

返回测试/部署数据上预测标签的分数。

predict_segments(X)

在测试/部署数据上预测段。

reset()

将对象重置为干净的初始化后状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类似字节的对象或 (.zip) 文件。

segments_to_change_points(y_sparse)

将段转换为变化点。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

sparse_to_dense(y_sparse, index)

将检测器的稀疏输出转换为密集格式。

transform(X)

在测试/部署数据上创建标签。

transform_scores(X)

返回测试/部署数据上预测标签的分数。

update(X[, y])

使用新数据和可选的真实标签更新模型。

update_predict(X[, y])

使用新数据更新模型并为其创建标签。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[source]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
parameter_setstr, 默认=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回 "default" 集。

返回值:
paramsdict 或 dict 列表
static change_points_to_segments(y_sparse, start=None, end=None)[源代码]#

将一系列变化点索引转换为段。

参数:
y_sparsepd.Series,整数类型,升序排序

一个包含变化点iloc索引的序列。

start可选,默认为0

第一个段的起始点。必须在第一个变化点之前,即 < y_sparse[0]。

end可选,默认为 y_sparse[-1] + 1

最后一个段的结束点。必须在最后一个变化点之后,即 > y_sparse[-1]。

返回值:
pd.Series

一个带有区间索引的序列,表示段的起始点和结束点。序列的值是段的标签。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.detection.base import BaseDetector
>>> change_points = pd.Series([1, 2, 5])
>>> BaseDetector.change_points_to_segments(change_points, 0, 7)
[0, 1)    0
[1, 2)    1
[2, 5)    2
[5, 7)    3
dtype: int64
check_is_fitted(method_name=None)[源代码]#

检查估计器是否已拟合。

检查属性 _is_fitted 是否存在且为 True。在调用对象的 fit 方法时,应将属性 is_fitted 设置为 True

如果不是,则抛出 NotFittedError

参数:
method_namestr,可选

调用此方法的函数的名称。如果提供,错误消息将包含此信息。

抛出:
未拟合错误

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取具有相同超参数和配置的对象的克隆。

克隆是一个不同的对象,没有共享引用,处于初始化后状态。此函数等同于返回 selfsklearn.clone

等同于构造一个 type(self) 的新实例,使用 self 的参数,即 type(self)(**self.get_params(deep=False))

如果在 self 上设置了配置,克隆也将具有与原始对象相同的配置,等同于调用 cloned_self.set_config(**self.get_config())

在功能上也等同于调用 self.reset,不同之处在于 clone 返回一个新对象,而不是像 reset 那样改变 self

抛出:
如果克隆不符合规范(由于 __init__ 错误),则抛出 RuntimeError。
clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个对象克隆标签作为动态覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

clone_tags 从另一个对象 estimator 设置动态标签覆盖。

clone_tags 方法只能在对象的 __init__ 方法中调用,即在构造过程中或通过 __init__ 直接构造之后调用。

动态标签的值设置为 estimator 中标签的值,名称由 tag_names 指定。

tag_names 的默认值是将 estimator 中的所有标签写入 self

当前的标签值可以通过 get_tagsget_tag 查看。

参数:
estimator:class:BaseObject 或其派生类的实例
tag_namesstr 或 list of str,默认为 None

要克隆的标签名称。默认值 (None) 克隆 estimator 中的所有标签。

返回值:
self

self 的引用。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

使用第一个测试参数集构造类的实例。

参数:
parameter_setstr, 默认=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回“default”集合。

返回值:
instance使用默认参数的类实例
classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称列表。

参数:
parameter_setstr, 默认=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果某个值没有定义特殊参数,则返回“default”集合。

返回值:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

namesstr 列表,与 objs 长度相同

第 i 个元素是测试中 objs 的第 i 个实例的名称。命名约定是如果实例多于一个则为 {cls.__name__}-{i},否则为 {cls.__name__}

static dense_to_sparse(y_dense)[源代码]#

将检测器的密集输出转换为稀疏格式。

参数:
y_densepd.Series
  • 如果 y_dense 只包含 1 和 0,则 1 表示变化点或异常。

  • 如果 y_dense 只包含大于 0 的整数,则它是一个段数组。

返回值:
pd.Series
  • 如果 y_dense 是变化点/异常的密集序列,则返回一个包含变化点/异常索引的 pandas 稀疏序列。

  • 如果 y_dense 是段的密集序列,则返回一个带有区间数据类型索引的稀疏序列。序列的值将是段的标签。

fit(X, y=None)[源代码]#

拟合训练数据。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

用于拟合模型(时间序列)的训练数据。

y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。

用于训练的已知事件,在 X 中,如果检测器是监督式的。

y 的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。

返回值:
self

对 self 的引用。

注意

创建拟合模型,更新以“_”结尾的属性。将 _is_fitted 标志设置为 True。

fit_predict(X, y=None)[源代码]#

拟合数据,然后进行预测。

使用给定的检测参数对 X 和 Y 进行模型拟合,并返回模型产生的检测标签。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

待转换数据

y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。

用于训练的已知事件,在 X 中,如果检测器是监督式的。

y 的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。

返回值:
y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame

检测到或预测的事件。

y 的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。

fit_transform(X, y=None)[源代码]#

拟合数据,然后进行变换。

使用给定的检测参数对 X 和 Y 进行模型拟合,并返回模型产生的检测标签。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

待转换数据

ypd.Series 或 np.ndarray,可选 (默认为 None)

待预测数据的目标值。

返回值:
y与 X 索引相同的 pd.DataFrame

序列 X 的标签。

  • 如果 task"anomaly_detection",值是整数标签。值为 0 表示 X 在同一时间索引处没有异常。其他值表示异常。大多数检测器将返回 0 或 1,但有些检测器如果能检测到不同类型的异常,可能会返回更多值。指示 X 在同一索引处是否为异常,0 表示否,1 表示是。

  • 如果 task"changepoint_detection",值是整数标签,指示变化点之间的段的标签。可能的标签是从 0 开始的整数。

  • 如果 task 是“segmentation”,值是段的整数标签。可能的标签是从 0 开始的整数。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

从类中获取类标签值,并继承父类的标签级别。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。

get_class_tag 方法是一个类方法,只考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它从对象中返回名称为 tag_name 的标签值,按以下优先级降序考虑标签覆盖

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

要检索可能带有实例覆盖的标签值,请改用 get_tag 方法。

参数:
tag_namestr

标签值的名称。

tag_value_default任意类型

如果未找到标签,则使用的默认/回退值。

返回值:
tag_value

selftag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类中获取类标签,并继承父类的标签级别。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_class_tags 方法是一个类方法,只考虑类级别的标签值和覆盖来检索标签的值。

它返回一个字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 属性的任何键。

值是相应的标签值,覆盖顺序按以下优先级降序排列

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

实例可以根据超参数覆盖这些标签。

要检索可能带有实例覆盖的标签,请改用 get_tags 方法。

不考虑通过 set_tagsclone_tags 在实例上设置的动态标签覆盖。

对于包含动态标签的覆盖,请使用 get_tags

collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集。不会被 set_tagsclone_tags 设置的动态标签覆盖。

get_config()[源代码]#

获取自身的配置标志。

配置是 self 的键值对,通常用作控制行为的临时标志。

get_config 返回动态配置,这些配置会覆盖默认配置。

默认配置设置在类或其父类的 _config 类属性中,并被通过 set_config 设置的动态配置覆盖。

在调用 clonereset 时会保留配置。

返回值:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后是来自 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[源代码]#

获取拟合参数。

所需状态

要求状态为“已拟合”。

参数:
deepbool,默认为 True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,则返回此对象的参数名称 : 值字典,包括可拟合组件的拟合参数(= BaseEstimator 类型参数)。

  • 如果为 False,则返回此对象的参数名称 : 值字典,但不包括组件的拟合参数。

返回值:
fitted_params带有 str 值键的 dict

拟合参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有拟合参数,如通过 get_param_names 所示,值是此对象该键的拟合参数值

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为 [componentname]__[paramname] componentname 的所有参数以 paramname 形式及其值出现

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的默认参数。

返回值:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls__init__ 中定义了默认值的所有参数。值是在 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
sortbool,默认为 True

是否按字母顺序排序返回参数名称 (True),还是按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回 (False)。

返回值:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按它们在类 __init__ 中出现的相同顺序返回。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
deepbool,默认为 True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值 dict,包括组件的参数(= BaseObject 类型参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值 dict,但不包括组件的参数。

返回值:
params带有 str 值键的 dict

参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括

  • 始终:此对象的所有参数,如通过 get_param_names 所示,值是此对象该键的参数值,值始终与构造时传递的值相同

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对 组件参数索引为 [componentname]__[paramname] componentname 的所有参数以 paramname 形式及其值出现

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从实例中获取标签值,并继承标签级别和覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tag 方法从实例中检索名称为 tag_name 的单个标签值,按以下优先级降序考虑标签覆盖

  1. 通过实例上的 set_tagsclone_tags 设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

参数:
tag_namestr

要检索的标签名称

tag_value_default任意类型,可选;默认为 None

如果未找到标签,则使用的默认/回退值

raise_errorbool

未找到标签时是否抛出 ValueError

返回值:
tag_valueAny

selftag_name 标签的值。如果未找到,则在 raise_error 为 True 时抛出错误,否则返回 tag_value_default

抛出:
ValueError,如果 raise_errorTrue

如果 tag_name 不在 self.get_tags().keys() 中,则抛出 ValueError

get_tags()[源代码]#

从实例中获取标签,并继承标签级别和覆盖。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典。标签可用于存储对象的元数据,或控制对象的行为。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。

get_tags 方法返回一个标签字典,其键是类或其任何父类中设置的 _tags 属性的任何键,或通过 set_tagsclone_tags 设置的标签。

值是相应的标签值,覆盖顺序按以下优先级降序排列

  1. 通过实例上的 set_tagsclone_tags 设置的标签,

在实例构造时。

  1. 在类的 _tags 属性中设置的标签。

  2. 在父类的 _tags 属性中设置的标签,

按继承顺序。

返回值:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性收集,然后是来自 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是包含其他对象作为参数的对象。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回值:
composite: bool

对象是否包含任何参数,其值是 BaseObject 的后代实例。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

检查对象的 _is_fitted` 属性,该属性在对象构造期间应初始化为 ``False,并在调用对象的 fit 方法时设置为 True。

返回值:
bool

估计器是否已 拟合

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
serialZipFile(path).open(“object) 的结果
返回值:
反序列化的 self,生成 cls.save(path)path 处的输出
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化内存容器加载对象。

参数:
serialcls.save(None) 输出的第一个元素
返回值:
反序列化的 self,生成 cls.save(None) 的输出 serial
predict(X)[源代码]#

在测试/部署数据上创建标签。

此方法返回特定于检测任务的类似列表的类型,例如,分段任务返回段,异常检测任务返回异常。

编码因任务和 learning_type(标签)而异,详见下文。

对于跨任务类型一致的返回值,请参阅 predict_pointspredict_segments

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

进行检测的时间序列,将分配标签或分数。

返回值:
y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame

检测到或预测的事件。

y 的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。

predict_points(X)[源代码]#

在测试/部署数据上预测变化点/异常点。

predict 的主要区别在于,即使任务不是异常或变化点检测,此方法也始终返回一个包含关注点的 pd.DataFrame

参数:
Xpd.DataFrame

进行检测的时间序列,将分配标签或分数。

返回值:
y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame

包含以下列的 pd.DataFrame

  • "ilocs" - 始终存在。值为整数,是 iloc 引用 X 索引,表示关注点。

  • "labels" - 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或异常聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中段的含义如下

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则值是变化点/异常的整数索引。

  • 如果 task"segmentation",则值是连续的段边界。

"labels" 是关注点的潜在标签。

predict_scores(X)[源代码]#

返回测试/部署数据上预测标签的分数。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

待标注数据(时间序列)。

返回值:
scores与 predict 返回值具有相同索引的 pd.DataFrame

序列 X 的预测分数。

predict_segments(X)[源代码]#

在测试/部署数据上预测段。

predict 的主要区别在于,即使任务不是分段,此方法也始终返回一个包含关注段的 pd.DataFrame

参数:
Xpd.DataFrame

进行检测的时间序列,将分配标签或分数。

返回值:
y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame

包含以下列的 pd.DataFrame

  • "ilocs" - 始终存在。值为左闭区间,左/右值是 iloc 引用 X 索引,表示段。

  • "labels" - 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中段的含义如下

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则这些区间是变化点/异常之间的区间,潜在标签是从 0 开始的连续整数。

  • 如果 task"segmentation",则值是分段标签。

reset()[源代码]#

将对象重置为干净的初始化后状态。

self 设置为构造函数调用后立即具有的状态,使用相同的超参数。通过 set_config 设置的配置值也会保留。

调用 reset 会删除任何对象属性,除了

  • 超参数 = 写入 self__init__ 参数,例如 self.paramname,其中 paramname__init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串“__”。例如,名为“__myattr”的属性会保留。

  • 配置属性,配置保持不变。也就是说,在 reset 前后调用 get_config 的结果是相等的。

类方法和对象方法,以及类属性也都不受影响。

等同于 clone,不同之处在于 reset 改变 self,而不是返回一个新对象。

调用 self.reset() 后,self 的值和状态与构造函数调用 type(self)(**self.get_params(deep=False)) 后获得的对象相等。

返回值:
self

类实例重置到干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类似字节的对象或 (.zip) 文件。

行为:如果 path 为 None,则返回内存中的序列化 self;如果 path 是文件位置,则将 self 以 zip 文件形式存储在该位置

保存的文件是 zip 文件,内容如下: _metadata - 包含 self 的类,即 type(self) _obj - 序列化的 self。此类使用默认的序列化方法 (pickle)。

参数:
pathNone 或文件位置 (str 或 Path)

如果为 None,则将 self 保存到内存对象;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果

  • path=”estimator”,则将在当前工作目录 (cwd) 创建一个 zip 文件 estimator.zip

  • path=”/home/stored/estimator”,则将在 /home/stored/ 中创建一个 zip 文件 estimator.zip

存储在 /home/stored/ 中。

serialization_format: str,默认为 “pickle”

用于序列化的模块。可用选项包括“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回值:
如果 path 为 None - 内存中的序列化 self
如果 path 是文件位置 - 指向该文件的 ZipFile
static segments_to_change_points(y_sparse)[源代码]#

将段转换为变化点。

参数:
y_sparsepd.DataFrame

一个段的序列。索引必须是区间数据类型,值应是段的整数标签。

返回值:
pd.Index

一个包含每个段起始点索引的 Index 数组。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.detection.base import BaseDetector
>>> segments =  pd.DataFrame({
        "ilocs": pd.IntervalIndex.from_tuples([(0, 3), (3, 4), (4, 5),
        (5, 6), (6, 7), (7, 8), (8, 10), (10, 11), (11, 12), (12, 20)]),
        "labels": [0, 2, 1, 0, 2, 1, 0, 2, 1, 0]
    })
>>> BaseDetector.segments_to_change_points(segments)
Index([0, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12], dtype='int64')
set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示

displaystr,“diagram”(默认)或“text”

jupyter kernel 如何显示 self 的实例

  • “diagram” = HTML 框图表示

  • “text” = 字符串输出

print_changed_onlybool,默认为 True

打印 self 时是否只列出与默认值不同的参数 (False),或列出所有参数名称和值 (False)。不嵌套,即只影响 self,不影响组件估计器。

warningsstr,“on”(默认)或“off”

是否触发警告,只影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将触发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会触发来自 sktime 的警告

backend:parallelstr,可选,默认为“None”

进行广播/向量化时用于并行化的后端,可以是以下之一

  • “None”:顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”:使用 dask,需要在环境中安装 dask

  • “ray”:使用 ray,需要在环境中安装 ray

backend:parallel:paramsdict,可选,默认为 {} (不传递参数)

作为配置传递给并行化后端的附加参数。有效键取决于 backend:parallel 的值

  • “None”:无附加参数,backend_params 被忽略

  • “loky”、“multiprocessing”和“threading”:默认的 joblib 后端。这里可以传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobs,但 backend 除外,它直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。这里可以传递 joblib.Parallel 的任何有效键,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,则默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”:可以传递 dask.compute 的任何有效键,例如 scheduler

  • “ray”:可以传递以下键

    • “ray_remote_args”:ray.init 的有效键字典

    • “shutdown_ray”:bool,默认为 True;False 阻止 ray 在并行化后

      关闭。

    • “logger_name”:str,默认为“ray”;要使用的日志记录器名称。

    • “mute_warnings”:bool,默认为 False;如果为 True,则抑制警告

返回值:
self对 self 的引用。

注意

改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

此方法适用于简单的 skbase 对象以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串 <component>__<parameter> 来访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果引用明确,例如没有两个组件参数同名 <parameter>,则也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**paramsdict

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。如果后缀 __ 在 get_params 键中唯一,则可以作为完整字符串的别名。

返回值:
self对 self 的引用(设置参数后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

为自身设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 self.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为从 random_state 导出的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 从链式哈希中采样,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 self 中的 random_state 参数,当且仅当 deep=True 时,也应用于剩余组件对象。

注意:即使 self 没有 random_state 参数,或者任何组件都没有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 对象,即使是那些没有 random_state 参数的对象。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None,默认为 None

用于控制随机整数生成的伪随机数生成器。传递 int 以便在多次函数调用中获得可复现的输出。

deepbool,默认为 True

是否在 skbase 对象值参数中设置随机状态,即组件估计器。

  • 如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。

  • 如果为 True,则也会在组件对象中设置 random_state 参数。

self_policystr,以下之一 {“copy”, “keep”, “new”},默认为“copy”
  • “copy”:将 self.random_state 设置为输入的 random_state

  • “keep”:self.random_state 保持原样

  • “new”:将 self.random_state 设置为新的随机状态,

从输入的 random_state 派生,并且通常与它不同

返回值:
self对 self 的引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将实例级别标签覆盖设置为给定值。

每个兼容 scikit-base 的对象都有一个标签字典,用于存储对象的元数据。

标签是特定于实例 self 的键值对,它们是对象构造后不会更改的静态标志。它们可用于元数据检查,或控制对象的行为。

set_tags 将动态标签覆盖设置为 tag_dict 中指定的值,其中键是标签名称,字典值是要设置的标签值。

set_tags 方法只能在对象的 __init__ 方法中调用,即在构造过程中或通过 __init__ 直接构造之后调用。

当前的标签值可以通过 get_tagsget_tag 查看。

参数:
**tag_dictdict

标签名称 : 标签值对的字典。

返回值:
Self

对 self 的引用。

static sparse_to_dense(y_sparse, index)[源代码]#

将检测器的稀疏输出转换为密集格式。

参数:
y_sparsepd.Series
  • 如果 y_sparse 是一个带有区间索引的序列,它应该表示段,其中序列的每个值都是段的标签。未分类的区间应标记为 -1。段的标签绝不能是 0。

  • 如果 y_sparse 的索引不是区间集,则序列的值应表示变化点/异常的索引。

index类数组

包含 y_sparse 中事件索引的更大的索引集,用作返回序列的索引。

返回值:
pd.Series

返回一个以 index 为索引的序列。* 如果 y_sparse 是变化点/异常的序列,则返回的

序列根据索引是否与异常/变化点相关联而标记为 0 和 1。其中 1 表示异常/变化点。

  • 如果 y_sparse 是段的序列,则返回的序列根据其索引所属的段进行标记。不属于任何段的索引标记为 -1。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.detection.base import BaseDetector
>>> y_sparse = pd.Series([2, 5, 7])  # Indices of changepoints/anomalies
>>> index = range(0, 8)
>>> BaseDetector.sparse_to_dense(y_sparse, index=index)
0    0
1    0
2    1
3    0
4    0
5    1
6    0
7    1
dtype: int64
>>> y_sparse = pd.Series(
...     [1, 2, 1],
...     index=pd.IntervalIndex.from_arrays(
...         [0, 4, 6], [4, 6, 10], closed="left"
...     )
... )
>>> index = range(10)
>>> BaseDetector.sparse_to_dense(y_sparse, index=index)
0    1
1    1
2    1
3    1
4    2
5    2
6    1
7    1
8    1
9    1
dtype: int64
transform(X)[源代码]#

在测试/部署数据上创建标签。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

进行检测的时间序列,将分配标签或分数。

返回值:
y与 X 索引相同的 pd.DataFrame

序列 X 的标签。

  • 如果 task"anomaly_detection",值是整数标签。值为 0 表示 X 在同一时间索引处没有异常。其他值表示异常。大多数检测器将返回 0 或 1,但有些检测器如果能检测到不同类型的异常,可能会返回更多值。指示 X 在同一索引处是否为异常,0 表示否,1 表示是。

  • 如果 task"changepoint_detection",值是整数标签,指示变化点之间的段的标签。可能的标签是从 0 开始的整数。

  • 如果 task 是“segmentation”,值是段的整数标签。可能的标签是从 0 开始的整数。

transform_scores(X)[源代码]#

返回测试/部署数据上预测标签的分数。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

待标注数据(时间序列)。

返回值:
scores与 X 索引相同的 pd.DataFrame

序列 X 的分数。

update(X, y=None)[源代码]#

使用新数据和可选的真实标签更新模型。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

用于更新模型(时间序列)的训练数据。

ypd.Series,可选

用于训练的真实标签,如果检测器是监督式的。

返回值:
self

对 self 的引用。

注意

更新已拟合模型,更新以“_”结尾的属性。

update_predict(X, y=None)[源代码]#

使用新数据更新模型并为其创建标签。

参数:
Xpd.DataFrame、pd.Series 或 np.ndarray

用于更新模型的时间序列训练数据。

y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame,可选。

用于训练的已知事件,在 X 中,如果检测器是监督式的。

y 的每一行都是一个已知事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是带标签的监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。

返回值:
y带有 RangeIndex 的 pd.DataFrame

检测到或预测的事件。

y 的每一行都是一个检测到或预测的事件。可以包含以下列

  • "ilocs" - 始终存在。值编码事件发生的地点/时间,通过 iloc 引用 X 的索引,或 X 的索引范围,如下所示。

  • "label" - 如果任务(通过标签指定)是监督或半监督分段,或段聚类。

"ilocs" 列和 "labels" 列中条目的含义描述了给定行中的事件,如下所示

  • 如果 task"anomaly_detection""change_point_detection",则 "ilocs" 包含事件发生的 iloc 索引。

  • 如果 task"segmentation",则 "ilocs" 包含基于 iloc 的段的左闭区间,解释为事件发生的索引范围。

"labels" 列中的标签(如果存在)指示事件的类型。